| 查看: 2039 | 回复: 9 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】更改源代码 并行出问题 已有6人参与
|
|||
|
我最近对lammps中 deposit的源代码进行了更改，然后编译运行在我的单核上都没问题，但在集群服务器上，就不能输出dump，运行会自动终止，也不报错，log文件变空白。但在单机运行是没问题的，自己解决了好久也不知道问题出在哪里，不知道有没有前辈有类似的经验。 我在deposit源文件中增加的代码如下： int i,j; > int flag,flagall; > double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq; > double *newcoord; > double **x = atom->x; > int *mask = atom->mask; > int nlocal = atom->nlocal; > int natoms; > int data = 0; > Region *region = domain->regions[iregion]; > > for(int i=0; i< nlocal ; i++) { > if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2])) data += 1; > } > MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world); 感觉就算其中涉及到并行问题的代码，也就是最后一句，都是模仿lammps源代码编写的，不知道问题出在哪里。 希望前辈能给予指点，万分感谢 谢谢了！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
281求调剂（0805）
已经有8人回复
-
环境领域全国重点实验室招收博士1-2名
已经有3人回复
-
材料专硕306英一数二
已经有10人回复
-
301求调剂
已经有6人回复
-
一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂
已经有7人回复
-
302求调剂
已经有6人回复
-
26博士申请
已经有3人回复
-
268求调剂
已经有3人回复
-
311求调剂
已经有10人回复
-
被我言中：新模板不强调格式了，假专家开始管格式了
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- VASP并行计算出错
已经有9人回复
- 关于 MS 5.5并行的问题
已经有4人回复
- 运行已经编译好的资源：vasp52opt.rar 出现并行不能用的问题！
已经有3人回复
- GPU并行计算C语言书籍或者源代码
已经有7人回复
- HTML源代码实现不了想要的效果，求助
已经有7人回复
- 高斯计算激发态并行问题
已经有6人回复
- 请问MS-linux-cluster安装之后无法并行的问题？
已经有5人回复
- 【求助】ms5.5单机多核并行问题
已经有9人回复
- 【求助】关于服务器多节点并行利用效率问题
已经有10人回复
- 【求助】两台电脑并行问题
已经有5人回复
- 【讨论】ADF版权的问题
已经有6人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
- 【求助】MS4.3/4.4多核处理器并行运算的问题
已经有24人回复
bluewhale
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 58 (初中生)
- 金币: 8438.3
- 散金: 50
- 红花: 10
- 帖子: 890
- 在线: 362.2小时
- 虫号: 278289
- 注册: 2006-09-10
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+3):谢谢指教 2010-09-15 22:55:55
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+3):谢谢指教 2010-09-15 22:55:55
|
> int flag,flagall; > double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq; > double *newcoord; > double **x = atom->x; > int *mask = atom->mask; > int nlocal = atom->nlocal; > int natoms; > int data = 0; > Region *region = domain->regions[iregion]; > > for(int i=0; i< nlocal ; i++) { > if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2])) data += 1; > } > MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world); 首先定位错误，将最后一行comment掉，编译后运行。如果没有问题，说明是最后一行的问题，检查world传入的是否有问题。 |
5楼2010-09-15 20:43:44
2楼2010-09-14 14:57:13
3楼2010-09-14 15:00:31
4楼2010-09-15 15:19:16
