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新虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】更改源代码并行出问题已有6人参与

我最近对lammps中 deposit的源代码进行了更改，然后编译运行在我的单核上都没问题，但在集群服务器上，就不能输出dump，运行会自动终止，也不报错，log文件变空白。但在单机运行是没问题的，自己解决了好久也不知道问题出在哪里，不知道有没有前辈有类似的经验。
我在deposit源文件中增加的代码如下：
int i,j;
>  int flag,flagall;
>  double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq;
>  double *newcoord;
>  double **x = atom->x;
>  int *mask = atom->mask;
>  int nlocal = atom->nlocal;
>  int natoms;
>  int data = 0;
>  Region *region = domain->regions[iregion];
>
>  for(int i=0; i< nlocal ; i++) {
> if (mask && groupbit && region->match(x[0],x[1],x[2]))  data += 1;
>  }
>  MPI_Allreduce(&data,&natoms,1,MPI_INT,MPI_SUM,world);
感觉就算其中涉及到并行问题的代码，也就是最后一句，都是模仿lammps源代码编写的，不知道问题出在哪里。
希望前辈能给予指点，万分感谢谢谢了！！

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1楼 2010-09-14 14:46:26

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★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-09-20 10:49:59

引用回帖:

Originally posted by bluewhale at 2010-09-15 20:43:44:
>  int flag,flagall;
>  double coord[3],lamda[3],delx,dely,delz,rsq;
>  double *newcoord;
>  double **x = atom->x;
>  int *mask = atom->mask;
>  int nlocal = atom ...

。。。。。把最后一行都去掉的话连并行语句都没。。。如何并行呢。。。
更别说定位错位了。。。。