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paladinlee铁杆木虫 (正式写手)
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【求助】dlpoly运算error——392的解决方法 已有4人参与
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DL_POLY terminated due to error 392error - too many link cells requested 我用NPT系综算出的问题，NVT算就没问题。 config和field应该没问题，都是一样的。 control文件如下： integrator leapfrog verlet temperature 300.00 pressure 0.0001 ensemble npt berendsen 1.0000 1.0000 steps 100000 equilibration 20000 multiple step 1 scale 10 print 10 stack 100 stats 10 trajectory 0 1000 0 rdf 10 timestep 0.0050 primary cutoff 5.000 cutoff 5.000 delr width 1.000 rvdw cutoff 5.000 no electrostatics shake tolerance 1.0E-5 quaternion tolerance 1.0E-5 ... 我看了手册，说要改参数，具体怎么改？ 谢谢！ |
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6楼2015-07-14 20:23:05
paladinlee
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-13 19:00:14
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-13 19:00:14
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错误的原因是link cell数超过了系统默认最大的link cell数，最简单的办法是加入no link 参数。 NVT下没问题，NPT有问题：说明NPT下，体积增大，导致link cell 过大。首先，你的压力设置为0.0001，相当于0.1个大气压，是否有误？ 你的初始盒子大小是否有误？应尽量接近实验值。 如果初始构型太差的话，分子之间排斥占主导，也会引起体积过度变动。模拟前可先进行opt 或0kmd 驰豫一下。 另外，控压驰豫时间可以改小一点试试。 link cell 是一种加速模拟的方法，具体可以看Frenkel 和 smit 分子模拟那本书的附录。 [ Last edited by 043114076 on 2010-10-13 at 18:50 ] |
3楼2010-10-13 18:47:06
paladinlee
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4楼2010-10-14 09:38:52
