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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】dlpoly运算error——392的解决方法
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dlpoly运算error——392的解决方法 已有4人参与

DL_POLY terminated due to error   392error - too many link cells requested
我用NPT系综算出的问题，NVT算就没问题。
config和field应该没问题，都是一样的。
control文件如下：
integrator leapfrog verlet
temperature      300.00
pressure         0.0001
ensemble npt berendsen   1.0000  1.0000

steps            100000
equilibration     20000
multiple step         1
scale                10
print                10
stack               100
stats                10
trajectory            0    1000       0
rdf                  10

timestep         0.0050
primary cutoff   5.000
cutoff           5.000
delr width       1.000
rvdw cutoff      5.000
no electrostatics
shake tolerance  1.0E-5
quaternion tolerance  1.0E-5
...
我看了手册，说要改参数，具体怎么改？
谢谢！
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我是胖人，不是粗人
1楼 2010-09-12 16:11:43
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李天帮

木虫 (正式写手)

小小木虫
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 043114076 at 2010-10-13 18:47:06
错误的原因是link cell数超过了系统默认最大的link cell数，最简单的办法是加入no link 参数。
NVT下没问题，NPT有问题：说明NPT下，体积增大，导致link cell 过大。首先，你的压力设置为0.0001，相当于0.1个大气压 ...

你好，请问一下OK下弛豫的参数该怎么设置啊？能否指导一下
赞一下 回复此楼
事虽难，做则成；路虽远，行则至。
6楼2015-07-14 20:23:05
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查看全部 6 个回答

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
这么久没人给力啊！！！
我再问一个
control 里的no link 语句怎么理解？
赞一下 回复此楼
我是胖人，不是粗人
2楼2010-10-13 16:23:58
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043114076

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-13 19:00:14
错误的原因是link cell数超过了系统默认最大的link cell数，最简单的办法是加入no link 参数。
NVT下没问题，NPT有问题：说明NPT下，体积增大，导致link cell 过大。首先，你的压力设置为0.0001，相当于0.1个大气压，是否有误？
你的初始盒子大小是否有误？应尽量接近实验值。
如果初始构型太差的话，分子之间排斥占主导，也会引起体积过度变动。模拟前可先进行opt 或0kmd 驰豫一下。
另外，控压驰豫时间可以改小一点试试。
link cell 是一种加速模拟的方法，具体可以看Frenkel 和 smit 分子模拟那本书的附录。

[ Last edited by 043114076 on 2010-10-13 at 18:50 ]
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-10-13 18:47:06
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
谢谢你的答复。参数的设定没有问题，是为了对比别人的结果。
其他的我再试试看
赞一下 回复此楼
我是胖人，不是粗人
4楼2010-10-14 09:38:52
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