应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】dlpoly运算error——392的解决方法
61/1返回列表
查看: 1299  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dlpoly运算error——392的解决方法 已有4人参与

DL_POLY terminated due to error   392error - too many link cells requested
我用NPT系综算出的问题，NVT算就没问题。
config和field应该没问题，都是一样的。
control文件如下：
integrator leapfrog verlet
temperature      300.00
pressure         0.0001
ensemble npt berendsen   1.0000  1.0000

steps            100000
equilibration     20000
multiple step         1
scale                10
print                10
stack               100
stats                10
trajectory            0    1000       0
rdf                  10

timestep         0.0050
primary cutoff   5.000
cutoff           5.000
delr width       1.000
rvdw cutoff      5.000
no electrostatics
shake tolerance  1.0E-5
quaternion tolerance  1.0E-5
...
我看了手册，说要改参数，具体怎么改？
谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
我是胖人，不是粗人
1楼 2010-09-12 16:11:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
这么久没人给力啊！！！
我再问一个
control 里的no link 语句怎么理解？
赞一下 回复此楼
我是胖人，不是粗人
2楼2010-10-13 16:23:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-13 19:00:14
错误的原因是link cell数超过了系统默认最大的link cell数，最简单的办法是加入no link 参数。
NVT下没问题，NPT有问题：说明NPT下，体积增大，导致link cell 过大。首先，你的压力设置为0.0001，相当于0.1个大气压，是否有误？
你的初始盒子大小是否有误？应尽量接近实验值。
如果初始构型太差的话，分子之间排斥占主导，也会引起体积过度变动。模拟前可先进行opt 或0kmd 驰豫一下。
另外，控压驰豫时间可以改小一点试试。
link cell 是一种加速模拟的方法，具体可以看Frenkel 和 smit 分子模拟那本书的附录。

[ Last edited by 043114076 on 2010-10-13 at 18:50 ]
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-10-13 18:47:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)
谢谢你的答复。参数的设定没有问题，是为了对比别人的结果。
其他的我再试试看
赞一下 回复此楼
我是胖人，不是粗人
4楼2010-10-14 09:38:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Darlingjack

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by paladinlee at 2010-10-14 09:38:52
谢谢你的答复。参数的设定没有问题，是为了对比别人的结果。
其他的我再试试看

你好，error392的问题你解决了吗？
赞一下 回复此楼
5楼2015-03-10 16:57:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

李天帮

木虫 (正式写手)

小小木虫
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 043114076 at 2010-10-13 18:47:06
错误的原因是link cell数超过了系统默认最大的link cell数，最简单的办法是加入no link 参数。
NVT下没问题，NPT有问题：说明NPT下，体积增大，导致link cell 过大。首先，你的压力设置为0.0001，相当于0.1个大气压 ...

你好，请问一下OK下弛豫的参数该怎么设置啊？能否指导一下
赞一下 回复此楼
事虽难，做则成；路虽远，行则至。
6楼2015-07-14 20:23:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 paladinlee 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +20 Lanmanbaby 2026-08-09 33/1650 2026-08-12 11:26 by lantianda
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭