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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 4 (幼儿园)
金币: 17609.8
红花: 1
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在线: 189.3小时
虫号: 1050994
注册: 2010-07-02
性别: GG
专业: 工程热物理相关交叉领域

[交流] 【求助】dlpoly运算error——392的解决方法已有4人参与

DL_POLY terminated due to error 392error - too many link cells requested
我用NPT系综算出的问题，NVT算就没问题。
config和field应该没问题，都是一样的。
control文件如下：
integrator leapfrog verlet
temperature    300.00
pressure       0.0001
ensemble npt berendsen 1.0000  1.0000

steps          100000
equilibration    20000
multiple step       1
scale             10
print             10
stack             100
stats             10
trajectory          0 1000    0
rdf                10

timestep       0.0050
primary cutoff 5.000
cutoff          5.000
delr width    1.000
rvdw cutoff    5.000
no electrostatics
shake tolerance  1.0E-5
quaternion tolerance  1.0E-5
...
我看了手册，说要改参数，具体怎么改？
谢谢！

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我是胖人，不是粗人

1楼2010-09-12 16:11:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

应助: 49 (小学生)
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专业: 理论和计算化学

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-13 19:00:14

错误的原因是link cell数超过了系统默认最大的link cell数，最简单的办法是加入no link 参数。
NVT下没问题，NPT有问题：说明NPT下，体积增大，导致link cell 过大。首先，你的压力设置为0.0001，相当于0.1个大气压，是否有误？
你的初始盒子大小是否有误？应尽量接近实验值。
如果初始构型太差的话，分子之间排斥占主导，也会引起体积过度变动。模拟前可先进行opt 或0kmd 驰豫一下。
另外，控压驰豫时间可以改小一点试试。
link cell 是一种加速模拟的方法，具体可以看Frenkel 和 smit 分子模拟那本书的附录。

[ Last edited by 043114076 on 2010-10-13 at 18:50 ]