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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【请教】晶体解析如何确定原子种类？
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)

[交流] 【请教】晶体解析如何确定原子种类？ 已有1人参与

如题。
一般的步骤已经学会了，简单的结构也学会解析了，但是遇到复杂的结构，看见密密麻麻的线就头大了，无论在xshell中，还是在XP中，都不能很好地定原子种类，请高手指点一二。
包括看些什么内容。弱弱地问几个问题：
1、两个原子之间的键长是原子半径吗？确定原子种类，主要是依据键长还是热振动系数？感觉热系数差别不大。
2、怎样根据别人已经解析出的晶体文件进行自学呢？主要看那些文件呢？谢谢！

请详细点。

请回答我的具体问题，后续问题请看第9楼

谢谢！

[ Last edited by wzgynkmlhf on 2010-9-11 at 13:12 ]
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1楼 2010-09-08 16:45:55
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)
帝夫:谢谢回帖交流~ 2010-09-10 23:01:24
顶上去。
我确定分子种类的时候，输入的是分子中的原子的符号，没有完整地输入一个理想的分子式。如果是简单的化合物，这样初解以后，很快就可以解析。复杂的就不行了，例如一个晶体，这样做后，金属原子倒是出来了，非金属原子全部成了Q峰。
请高手指点！谢谢
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3楼2010-09-09 08:29:34
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普通回帖

zhonggao18

荣誉版主 (职业作家)
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-09 08:29:33
wzgynkmlhf(金币+3):如果不知道配体结构呢？也就是说配体或许分解了呢？如何定位金属原子呢？谢谢！ 2010-09-11 13:04:10
根据具体的经验来判断，知道的配体的结构，一般是从金属原子周围开始的，例如配位的原子一般是O和N等，键长也可以，知道原子是什么了，在根据与他相连的原子的键长判断可能的原子！！
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2楼2010-09-08 17:13:00
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gohappy

铜虫 (正式写手)
★
帝夫(金币+1):谢谢回帖交流~ 2010-09-10 23:01:41
wzgynkmlhf(金币+1):谢谢。如果碳都解出来了，自然加氢就可以了。我感觉困难的是不知道哪些是金属和非金属。 2010-09-11 13:05:10
看你用什么原料，金属不多的话就好办了，非金属非氢可以像用C来解，初结构出来了，根据你的原来再进一步修改，一步一步修正就可以看到了较好的结构模型
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4楼2010-09-09 21:52:27
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)
帝夫:谢谢回帖交流~ 2010-09-10 23:01:47
顶上去，祝各位老师教师节快乐！
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5楼2010-09-10 22:11:54
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)
★
帝夫(金币+1):谢谢回帖交流~ 2010-09-10 23:02:03
wzgynkmlhf(金币+3):谢谢。我最近的一个结构，杀Q峰以后，连接的都是金属原子，傻眼了。再请教，合理的温度因子怎么看呢？有没有一个大概的范围，谢谢！ 2010-09-11 13:06:21
主要是根据原来推断金属原子，然后是找六元环（benzene,Py）等！多练习就会很快知道了。

合理的定位得到合理的温度因子。
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淡泊名利，宁静致远。
6楼2010-09-10 22:45:15
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葶苈狮语

银虫 (小有名气)
wzgynkmlhf(金币+1):谢谢。我需要的是具体的指点，而不是大家都知道的东西。一般步骤我早就会了。 2010-09-11 13:07:01
元素分析仪加RDX
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7楼2010-09-11 11:34:41
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zjchen

木虫 (正式写手)

如题

wzgynkmlhf(金币+1):谢谢。问题是，如果配体分解了呢？我现在先要解决的的是如何入手的问题，而不是更复杂的问题。简单结构，一般步骤就会了的。 2010-09-11 13:08:02
自己做的结构，自己应该有数的，难的是解一点都不知道的东西，还有会出现一些莫名奇妙的问题！
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每天都很痛苦
8楼2010-09-11 12:50:49
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)

顶上去，加了金币了。
再请教，我需要的是入手的指点。一般步骤，我已经把所有可以找到的资料都浏览了一次了。
如果是简单，数据好的结构，自然非常好解析的
请各位老师指点。
1、怎么看温度因子是否合理？
2、输入分子组成时候，输入的只是原子符号，可以不？如果这样子，杀了Q峰以后，得到的都是金属相连的结构，怎么解析呢？
3、键长是否就是原子半径的加和，在一般情况下？
谢谢~
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9楼2010-09-11 13:11:41
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lijianghua2007

荣誉版主 (职业作家)
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-12 10:06:08
wzgynkmlhf(金币+20):谢谢您，帮助很大~~ 2010-09-13 14:37:16
一般温度因子<=0.08，最好小于0.05

只要输入原子种类即可。杀了Q峰以后，得到的都是金属相连的结构---说明空间群错了。

一般是原子半径的加和值可得这种化学键的典型键长。若再考虑两个原子电负性差异的大小予以适当校正，和实际测定制会符合得很好。
键   型        类  型        键 长        键   型        键 长

C--C                1.53        C--Br        1.87~1.96
        C—C(=C)        1.51        C--Cl        1.72~1.85
        C—C(≡C)        1.47        C--F        1.32~1.43
C=C                1.32        C--I        2.13
        共轭/芳环        1.38        C--P        1.80
C≡C                1.18~1.20        C-S        1.82
C--N                1.47~1.50        (C--)NO2        1.21~1.22
C=N        共轭        1.34~1.38        P--O        1.56~1.68
C—O(H)                1.41~1.44        S--O        1.58
C—O        C—O(--C)        1.42~1.46        Cl--O        1.40
        (C=)C--O        1.30~1.39        C--B        1.59
C=O                1.19~1.23        B--O        1.48
        羧酸根        1.21~1.23        P--F        1.58

其他参考陈小明的单晶结构分析书P125
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淡泊名利，宁静致远。
10楼2010-09-12 09:09:24
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