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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【讨论】用VMD作的RDF图片不知有没有问题
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】用VMD作的RDF图片不知有没有问题 已有15人参与




用VMD作的RDF图片不知有没有问题---体系是 Ni-Al
第一张图片是Al-Al的RDF
第二张图片是Ni-Ni的RDF
RDF到底分析那些元素？
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1楼 2010-09-06 16:55:24
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xunbao15

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-10 10:04:55
主要看前几个峰的位置，以及峰的相对高度和形状，可以反映出键长及相对比例，晶格长度等。找本基本的分子动力学书籍，上面都应该有的。
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2楼2010-09-10 04:10:42
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-09-10 15:59:57
你的问题就是RDF到底分析那些元素？
这跟元素无关 只是对坐标的分布规律进行统计
它才不管你是镍是铝 你给的是啥就分析啥
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3楼2010-09-10 10:06:14
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Light5392

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-09-10 16:00:06
g{r）在r趋于无穷时应该收敛于1
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4楼2010-09-10 13:25:38
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
明白了一些，谢谢各位了
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5楼2010-09-10 15:49:41
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wusongz

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by xiaowu787 at 2010-09-06 16:55:24:



用VMD作的RDF图片不知有没有问题---体系是 Ni-Al
第一张图片是 ...

搭车同问我这种情况，为什么VMD用vasp结果计算g(r)会在某处截止啊
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----Whathappenedtoyou?----Life.
6楼2011-05-10 22:54:26
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cjl2010-hit
7楼2011-07-02 10:58:27
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yorckzhang

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by xiaowu787 at 2010-09-10 15:49:41:
明白了一些，谢谢各位了

lammps只算到势函数的截断距离
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疾风知劲草，版荡识诚臣。
8楼2011-09-12 18:37:20
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xieluxielu

木虫 (著名写手)

天天
★ ★ ★
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ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-15 12:54:20
第一个峰是最近邻原子的位置，第二个峰是次紧邻的位置，以此类推，lz 可以根据一些参数算出最近邻次紧邻的值，以此进行比较，判断，或者对rdf的值进行傅里叶转换得出结构因子的图谱，直接与实验数据进行比较
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9楼2011-09-15 04:22:36
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sdzjc1988

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-22 13:54:01
引用回帖:
8楼: Originally posted by yorckzhang at 2011-09-12 18:37:20:
lammps只算到势函数的截断距离

算到cutoff distance已经足以反映物质结构了，一般还是用LAMMPS自带命令算RDF比较好~
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10楼2011-09-22 02:30:33
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