【讨论】用VMD作的RDF图片不知有没有问题 - 分子模拟 - LAMMPS/DL_POLY

11楼2014-05-05 16:24:39

139564@chen

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lz你好，请问在VMD如何实现RDF,谢谢！997955354这是我的QQ，期待你的回复，谢谢！

杂草就要用杂草的方式去生活

12楼2014-10-23 21:58:51

lanlinger13

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12楼: Originally posted by 139564@chen at 2014-10-23 21:58:51
lz你好，请问在VMD如何实现RDF,谢谢！997955354这是我的QQ，期待你的回复，谢谢！

vmd中先加载兄需要分析的history文件，然后在extensions中选择anlayse中的rdf(g(r)),即可得曲线等

13楼2014-12-22 14:35:23

18717718552

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13楼: Originally posted by lanlinger13 at 2014-12-22 14:35:23
vmd中先加载兄需要分析的history文件，然后在extensions中选择anlayse中的rdf(g(r)),即可得曲线等...

history 文件格式是什么样的？

14楼2015-06-07 12:52:11

lanlinger13

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14楼: Originally posted by 18717718552 at 2015-06-07 12:52:11
history 文件格式是什么样的？...

DL_POLY运行结束后，即可得到其输出文件history，相关于每个时刻点上院子的位置，速度，位移的一个文件，可以看看DL_POLY的手册，都有详细讲解的。

15楼2015-06-08 07:51:10

发条鸟1

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楼主你这个是VMD导出来就是这样的吗？我的纵坐标是0.00001的数量级，不知道要怎么归一化啊

16楼2015-09-21 16:09:18

453695608

银虫 (正式写手)

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8楼: Originally posted by yorckzhang at 2011-09-12 18:37:20
lammps只算到势函数的截断距离...

能不能问问截断距离是在哪里看的？

学习更多的知识，为了未来

17楼2015-10-08 14:40:30