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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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zhuangshl

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何采用gauss计算分子的ECD 光谱?已有6人参与

用TDDFT计算出化合物的ECD的结果后,怎么可以将数据图形化?

例如论文:http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/np100063q

表3是实验和gauss 09 计算的电子圆二色谱ECD光谱曲线, 采用DFT:    B3LYP/aug-cc-pVDZ//B3LYP/6-311++G(2d,2p)

请问计算结束后如何去得到ECD光谱曲线呢? 麻烦大家给指点一下如何一步步得到该曲线。我在网页http://www.baisi.net/viewthread.php?tid=2815656 发现以下内容:

计算所得Rotational strenth,Exitation energy,两项
根据gaussian公式,在origin中作图!
gaussian公式可参见文献:J Phys Chem A 2003,107, 2524-2539
现在ECD模拟不能直接出图,只能根据高斯峰形或者洛仑兹峰形进行模拟。
一般ECD用高斯峰形,而VCD用洛仑兹峰形。

但是还是不知道如何去手工去计算,麻烦大家指点一下。
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你下载一个swizard软件(免费软件),你说的问题就全解决了
swizard提供高斯和洛伦兹两种展宽方式
2楼2010-09-06 10:12:55
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zhuangshl

银虫 (小有名气)

非常感谢yjcmwgk   !
3楼2010-09-06 12:25:06
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happy20086928

木虫 (小有名气)

求助:ECD计算结果如何转化为图


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我想计算化合物的ECD图谱,但是在Gaussview中只能看到UV-Vis图谱,怎样看到ECD图谱呢?从网上找了一些方法,包括origin作图、SWizard软件等,但还是一头雾水。请专家指点一下。
万分感谢!

[ Last edited by happy20086928 on 2010-11-30 at 16:39 ]
4楼2010-11-30 10:32:41
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star2010

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
从计算的ECD谱图,除了能知道手性外,还能得到什么信息?比如出峰位置,还有正负都有什么意义啊?望赐教!
5楼2010-12-01 16:18:38
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yishengheqiu

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也遇到了这个问题,g09不能直接读出谱图,哪位大侠能具体告诉我怎么做出来,文章在修改,紧急求助中...本人qq:875082098,哪位高手知道直接联系我也行
计算化学生涯才刚刚开始
6楼2011-01-18 22:01:13
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fudanliutao

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
想问下如何计算Rotational strenth 和 Exitation energy  QQ396503218
7楼2013-05-13 17:02:20
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fudanliutao

新虫 (初入文坛)

内容已删除
8楼2013-05-13 17:03:17
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