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hapwave

荣誉版主 (著名写手)

向日阳光

[交流] 【求助】如何重新合并 Friedel data 已有3人参与

昨天投的ACTA E今天编辑回信了:
意见如下:Mo Ka measured Friedel data cannot be used to determine absolute structure in a light atom study.  Accordingly, you will need to merge the Friedel data and re-refine the structure.

哪位热心的虫子帮忙看看如何解决,谢谢啦!

本人不是学晶体的,希望能讲一些具体的操作。

[ Last edited by hapwave on 2010-9-2 at 13:59 ]
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hapwave

荣誉版主 (著名写手)

向日阳光

★ ★
wsht212(金币+2):lz的这个帖子是比较专业的分析了啊,今天看的xi2004老师发的一篇文章中也讲了! 2010-09-05 22:37:23
请问merg 2或3或4有何区别?


3. 如果绝对构型确定不了怎么办?

有时候, 由于没有>Si的重原子, 或Friedel pairs的数目不够多, 或者是racemic twin, 结果flack 参数没有靠近0,而且偏差大, 比如 0.49(13). 这时候, 绝对构型无法靠反常散射来确定, 那么, Friedel pairs要被合并掉, 具体如下.

1). 在.ins中加 merg 3, 精修到收敛

2).  在CIF中加
_chemical_absolute_configuration  unk

  在CIF中删去

_refine_ls_abs_structure_details  'Flack (1983), 1283 Friedel pairs'
_refine_ls_abs_structure_Flack    ?

3). 要在refine special一栏说明绝对构型不确定的原因.
7楼2010-09-05 21:07:46
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查看全部 8 个回答

xuanyuanjie

至尊木虫 (职业作家)

木虫隐修士

★
hapwave(金币+5):哦,明白了!多谢您的热心参与啦 2010-09-02 14:24:13
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-09-05 22:36:00
Mo靶不行换Cu靶。
我思故我在,神与我同在。
4楼2010-09-02 14:20:32
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
nash603(金币+1):谢谢回贴交流! 2010-09-02 19:43:05
hapwave(金币+50):十分感谢,再加点分给您! 2010-09-03 12:46:15
在ins文件中加入“merge 3" 精修,把用'merge 2"精修2次所得的_refine_ls_number_reflns          xxx

相减就可以得到一个“_refine_ls_abs_structure_details
'Flack H D (1983), Acta Cryst. A39, 876-881, xxx Friedel  pairs'

_refine_ls_abs_structure_Flack    unk 加入到cif文件中。

[ Last edited by ljmmarise on 2010-9-2 at 17:52 ]
5楼2010-09-02 17:51:42
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hapwave

荣誉版主 (著名写手)

向日阳光

帝夫:感谢回帖交流! 2010-09-05 23:36:06
我的化合物原料 构型是已知的, 能不能根据这个 推断产物的构型呢?
6楼2010-09-03 13:59:22
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