应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】做过大引物全质粒PCR的进来看
52/1返回列表
查看: 4263  |  回复: 29
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wgl365

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】做过大引物全质粒PCR的进来看

最近在做大引物全质粒PCR以构建随机突变文库，参考的文献是Creating Random Mutagenesis Libraries by Megaprimer PCR of Whole Plasmid (MEGAWHOP)
作者：Kentaro Miyazaki。文章出自Directed Evolution Library Creation：methods and protocols  （Methods in Molecular Biology, 2003, Volume 231, I, 23-28, DOI: 10.1385/1-59259-395-X:23 ） ，此外还有一篇文章Creating random mutagenesis libraries using megaprimer PCR of whole plasmid，作者：Miyazaki K, Takenouchi ，文章出自.Biotechniques. 2002 Nov;33(5):1033-4, 1036-8.

这里我是用易错PCR的产物做大引物，易错PCR回收电泳图如1所示，用的是2000的marker，易错PCR产物在1000bp左右，这个没什么问题，可是在大引物PCr结果如图2所示，我的目标质粒是7K，两边为marker，一个5000，一个10000，中间两个是结果，求解，为什么加样孔处一片亮而没有我的目的带，照道理即便条件没有优化至少也该有目的为7K的带吧。凝胶凝固后放的时间有点长了，跑的结果不好。
我大引物PCr用的是Takara的PrimeSTAR HS DNA Polymerase,浓度：2.5U/uL，pcr的反应体系总计50uL：其中大引物约0.5ug，模版DNA50ng，0.2mM的dNTP，PrimeSTAR HS DNA Polymerase用0.5ul，也就是1.25U，我的目标质粒是7K，PCR反应程序：98 ℃，1min——98℃，10s——55℃，5s——72℃，7min——72℃，7min——4℃保存（基本按酶的使用说明书进行）。反应共20个循环，求高人解答为什么会变成这个样子。
图1-易错PCR产物回收

图2-大引物PCR结果


[ Last edited by wgl365 on 2010-8-31 at 20:44 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
思想是行动的种子！
1楼 2010-08-31 20:38:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wgl365

银虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by tete1987 at 2013-12-26 13:04:40
点饱和突变，用的是小引物，很好P的。
大引物易错PCR，这个用的是长片段当引物，不太好P。但是按照文献的方法能够扩增出来。我已经转化了，能长很多，比酶切连接的效率高多了。...

也再做蛋白改造吧，你是哪个学校的啊？
赞一下 回复此楼
思想是行动的种子！
13楼2013-12-30 09:00:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 30 个回答

xiangshengyan

木虫 (正式写手)
wgl365(金币+1):感谢顶帖 2010-08-31 21:04:23
我觉得没跑开 你的PCR还是成功的 7K很大了 不知道你的胶的浓度时多少
赞一下 回复此楼
ANNA&KEVIN
3楼2010-08-31 20:52:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wgl365

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiangshengyan at 2010-08-31 20:52:55:
我觉得没跑开 你的PCR还是成功的 7K很大了 不知道你的胶的浓度时多少

1%的琼脂糖凝胶，不是7k太大的原因，10000的marker都能跑开，平时我们跑毕赤酵母的pPIC9k也是这个浓度，都能跑开
赞一下 回复此楼
思想是行动的种子！
4楼2010-08-31 21:03:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

墨香若水

木虫 (著名写手)

小小囧虫
wgl365(金币+5):呵呵，试试 2010-10-05 19:40:08
又是你啊。不知你实验怎么样，刚看到你的求助。
我的建议：
1.不要用primerstar,用Pfu.
2酶量50微升体系要加1u的酶，因为P的时间比较长。
3程序按照文献的程序
GOOD LUCK
别忘给我金币
赞一下 回复此楼
仕不可不弘毅，任重而道远
5楼2010-10-04 21:43:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 30 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料类求调剂 +6 wana_kiko 2026-02-28 6/300 2026-02-28 21:20 by gaoxiaoniuma
[考研] 求调剂 +4 repeatt?t 2026-02-28 4/200 2026-02-28 21:16 by gaoxiaoniuma
[考研] 284求调剂 +4 天下熯 2026-02-28 4/200 2026-02-28 21:13 by gaoxiaoniuma
[考研] 高分子化学与物理调剂 +4 好好好1233 2026-02-28 7/350 2026-02-28 20:42 by 好好好1233
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧？ +5 ieewxg 2026-02-25 5/250 2026-02-28 20:11 by iwuli
[考博] 博士推荐 +5 花儿笑? 2026-02-21 6/300 2026-02-28 18:53 by nxgogo
[考研] 0856材料求调剂 +10 hyf hyf hyf 2026-02-28 11/550 2026-02-28 18:50 by 无际的草原
[考研] 311求调剂 +7 南迦720 2026-02-28 7/350 2026-02-28 18:28 by leonnulll
[考研] 材料学调剂 +4 提神豆沙包 2026-02-28 4/200 2026-02-28 18:26 by houyaoxu
[考研] 285求调剂 +5 满头大汗的学生 2026-02-28 5/250 2026-02-28 18:10 by 材料专硕调剂；
[考研] 材料调剂 +3 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:06 by houyaoxu
[考博] 博士自荐 +3 kkluvs 2026-02-28 3/150 2026-02-28 16:59 by StarAura
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[考研] 295求调剂 +4 19171856320 2026-02-28 4/200 2026-02-28 13:39 by ms629
[考研] 0856调剂 +3 刘梦微 2026-02-28 3/150 2026-02-28 13:22 by houyaoxu
[考研] 寻找调剂 +3 LYidhsjabdj 2026-02-28 3/150 2026-02-28 12:59 by miniwendy
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 9/450 2026-02-28 12:32 by seaskyy
[基金申请] 什么是人一生最重要的？ +10 瞬息宇宙 2026-02-21 10/500 2026-02-27 08:46 by tfang
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭