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【请教】请教各位高手一个难解决的B类错误 已有2人参与
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碰到一个B类错误，不知如何解决，提升空间群后，空间群没变化，还是P2(1)/c，这个B类错误依旧存在。 PLAT112_ALERT_2_B ADDSYM Detects Additional (Pseudo) Symm. Elem... S 请教各位高手，望不吝赐教，万分感谢！ |
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chem2012(金币+1): 2010-08-27 09:34:58
wsht212(金币+4):谢谢交流，希望常来！多奖励一个，谢谢lz 2010-08-27 20:03:37
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S 是硫吧， 前面那个单词可能是element。 这个Pseudo Symmetry 好像叫雁对称。 所谓赝对称性（pseudo-symmetry）的结构，简言之，就是晶体结构中，含有某 些比较重的原子（如稀土等重金属，或溴、碘之类的非金属），他们在晶体中处于某 些特殊位置，使得自身的对称性高于轻原子及晶体整体的对称性。例如，他们具有 额外的平移或中心对称性。这时，在直接法或帕特森法的电子密度图上就会相应造 成所谓轻原子的“多解”，即电子密度图中，轻原子除了在正确位置上出现之外，还 在一个或者多个错误的位置上出现。相应的多解形式分为平移多解和倒反多解，分 别为赝平移对称性（pseudo-translation）和赝倒反对称性（pseudo-inversion）。这些多 解造成了难以直接从普通直接法或帕特森法的电子密度图上获得正确的结构或结构 片段，所以称难解的结构。 人工破解赝对称性的结构比较麻烦，一般可以采取以下办法。在直接法或或帕 特森法的电子密度图上，除了得到重原子的坐标之外，先从最高的电子密度峰中， 找出几何合理的一两个原子或一个基团，进行几轮最小二乘法精修。如果这些原子 完全属于多解中的同一套解（可以是任何一套解）的原子，则可能部分（当然还不 完全）破解了赝对称性引起的多解，并促进新的正确原子在随后的傅立叶合成图中 以较高电子密度峰形式出现。利用结构化学等知识，小心挑选出最可能正确的几个 原子，并重复前面的过程，直至大部分原子被确定下来，就可以破解赝对称性的结 构。注意，每次挑选原子必须非常小心，因为选错原子，就会加强赝对称性效应， 反而妨碍破解赝对称性结构的努力。 顺便指出，一些可以免费下载的晶体结构分析程序，如SAPI 和SIR等， 具有破解赝对称性结构的能力。利用这些程序可以进行相当自动化的结构解析。 摘自：单晶结构分析的原理 与实践 陈小明 蔡继文 我也不是很明白，希望多多交流 [ Last edited by cluster8676 on 2010-8-27 at 01:30 ] |
7楼2010-08-27 01:22:59
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