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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助成功】g09内存利用率小的问题！（有奖）
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shuo2008

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助成功】g09内存利用率小的问题！（有奖）

我用的是服务器,两个八核的CPU， 内存是16G   
装的是64位的CentOS5.4,gaussian版本是g09！

输入文件设置的是用内存15000MB  CPU使用16个


运行时，16个CPU全部显示利用率100％
可是内存为啥只用了1G 多！
运行了一整夜，内存使用还是1G附近！

本人安装步骤如下：
用户名为：gaussian
#pwd
/home/gaussian

mkdir tmp  
我直接将g09.tar.bz2压缩包拷到/home/gaussian 并解压，不是用的命令形式，直接在上面点右键解压，得到g09安装文件夹

#cd g09
#./bsd/install (看清楚，不要修改这里的任何东西）
#cd /home/gaussian
vi ~/.bashrc
==========添加以下的东西======
### Gaussian Configuration      ###
export g09root=/home/gaussian
export GAUSS_SCRDIR=/home/gaussian/tmp
source $g09root/g09/bsd/g09.profile
=====Cut Here================

(我看别人用的是source $g09root/g09/bsd/g09.login，可是我的用g09.login出现错误，用g09.profile倒是能安装！不知道这儿有没有影响？)
exit
然后再次登录运行，可是内存使用率还是很低！ 也就1G~2G，该怎么办啊？

[ Last edited by shuo2008 on 2010-8-30 at 14:44 ]
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1楼 2010-08-24 17:14:55
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shuo2008

金虫 (正式写手)
顶一下啊
！
2楼2010-08-24 23:25:12
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★
shuo2008(金币+3): 2010-08-25 09:02:23
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！！ 2010-08-25 09:10:22
shuo2008(金币+2):谢谢啊！ 2010-08-30 14:42:48
你唯独没说的是你的gaussian版本。这也是主要的判据。
如果是g03，通常你写多少他就先占满了——别管用不用得到。
如果是g09，通常他用多少就显示多少——随时在变，不超过你写的限制。
其次的判据在于你的计算量，以及在计算的哪个进程中，比如301不会用多少内存，而502之类的需求就很大。
赞一下(1人) 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
3楼2010-08-25 07:34:29
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shuo2008

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-08-25 07:34:29:
你唯独没说的是你的gaussian版本。这也是主要的判据。
如果是g03，通常你写多少他就先占满了——别管用不用得到。
如果是g09，通常他用多少就显示多少——随时在变，不超过你写的限制。
其次的判据在于你的计算 ...

装的是g09，等会看一下运算在那个层次！
有没有其他的地方提高内存使用量啊？
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4楼2010-08-25 09:03:38
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shuo2008

金虫 (正式写手)
刚去看了，在算L502的时候还是1G内存，而且算了一晚上只算了215kB的输出文件，我算的分子体系可是有100个原子多呀！
   是哪有问题？愁呀！

[ Last edited by shuo2008 on 2010-8-25 at 10:30 ]
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5楼2010-08-25 09:21:11
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shuo2008

金虫 (正式写手)
高手帮忙啊！
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6楼2010-08-25 19:04:39
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shuo2008

金虫 (正式写手)
今天把g03装上，结果内存使用率和g09基本一样！ 高手指点一下为什么啊？  
是不是和系统有关系啊？
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7楼2010-08-26 14:39:07
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
shuo2008(金币+2):谢谢！ 我看了一下其实给他分了15G，用了只有600M附近！ 我不管了！ 只要能算就行！ 2010-08-26 22:57:28
shuo2008(金币+2): 2010-08-30 14:43:07
用多少内存是和体系、方法相关的，假如一个作业最多就只需要1G的内存，你非要给他15G的内存，那不是浪费吗？没必要纠结于作业到底用了多少内存，如果他用的不到你设置的，就说明这么些内存够了。程序又不傻，你给他内存它不用，非得在硬盘上读写。
引用回帖:
Originally posted by shuo2008 at 2010-08-26 14:39:07:
今天把g03装上，结果内存使用率和g09基本一样！ 高手指点一下为什么啊？  
是不是和系统有关系啊？

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8楼2010-08-26 19:34:37
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zyxme625
shuo2008(金币+1): 2010-08-26 22:57:43
9楼2010-08-26 19:52:20
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zhanping

金虫 (正式写手)
就是只要能算就好了，我的也是这样！ 给他分好多内存，结果也只用一点！
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10楼2010-08-27 12:18:15
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