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wyp405790520

木虫 (小有名气)

[交流] 【交流】如何解决这样一个B级错误

大家好,请问有这样一个B级错误:
Alert level B
PLAT601_ALERT_2_B Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     124.00 A**3
我试了好多办法,但没有残余的峰可以定义为溶剂分子,那为朋友遇到的话,如何解决,请指导一下,不胜感谢!
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sdq1985

铜虫 (正式写手)

2楼2010-08-17 21:06:28
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realsw

木虫 (初入文坛)

★ ★
帝夫(金币+2):感谢回帖交流! 2010-08-18 17:59:24
有时候溶剂的占有率可能不是1。
实在不行的话参考SQUEZZ的办法。用platon试试
3楼2010-08-18 17:56:54
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wyp405790520

木虫 (小有名气)

回复

您好!这位朋友,请问squezz和platon怎么用,请指点一下,谢谢1
4楼2010-08-19 07:52:19
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
帝夫(金币+3):谢谢回帖交流! 2010-08-19 10:07:01
wyp405790520(金币+2): 2010-08-20 07:53:31
引用回帖:
Originally posted by wyp405790520 at 2010-08-19 07:52:19:
您好!这位朋友,请问squezz和platon怎么用,请指点一下,谢谢1

squeeze不是用来解决溶剂无序的问题,而是用来将那些无序溶剂分子队衍射的
贡献去掉,这样就可以是使R值和残余峰都降低,但是那些溶剂分子就没法确认了。
使用很简单,将你解好的包含分子骨架的ins文件,用platon或者winGX打开,直接点
squeeze会生成一个新的hkl文件(有时是hkp文件,将其改成hkl),用这个新的hkl精
修就可以了。如果程序认为你的孔洞中不含无序的溶剂分子,
则可能不会生成上述的hkl文件。 Platon--DATA--squeeze
▄︻┻┳═一................................................
5楼2010-08-19 08:14:57
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wyp405790520

木虫 (小有名气)

回复

非常感谢这位朋友的帮助!
我试试,谢谢!
6楼2010-08-20 07:54:10
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