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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 其他 » 【求助】高分求助：怎么计算蛋白质的振动态密度和频率？
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pengxin8086

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】高分求助：怎么计算蛋白质的振动态密度和频率？

向各位高手请教一个问题，就是如果知道蛋白质原子的坐标，怎么计算出蛋白质的振动态密度和频率（即具体的计算步骤）。我看文献里面好像用到简正模式分析和高斯网络模型。如能解决这个问题，一定重金奖励！
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1楼 2010-08-16 18:26:58
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fegg7502

荣誉版主 (知名作家)

无

优秀版主
★ ★ ★
pengxin8086(金币+1):谢谢参与
luoqiquan(金币+2):thank you very much 2010-08-16 21:52:27
先根据这个坐标，建起来分子模型，，然后优化结构，然后在优化好的结构去计算频率，大致就这样，
看你使用的什么软件，再讨论具体操作，
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心诚意正，方可始终；身无苦灭，永登光明。
2楼2010-08-16 18:52:01
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yznian

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
pengxin8086(金币+1):谢谢参与
luoqiquan(金币+1):thanks 2010-08-16 21:52:36
楼主用的什么软件呢？说清楚才好说 诚如楼上所言
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3楼2010-08-16 19:32:46
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pengxin8086

铁杆木虫 (著名写手)
我就是不清楚用什么软件和方法，只是感觉文章里面用的方法是简正模式分析和高斯网络模型。所以请教各位有没有做过这一方面的研究。
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4楼2010-08-16 22:25:52
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