24小时热门版块排行榜    

查看: 2662  |  回复: 8

miaoskypop

铜虫 (小有名气)

[交流] 【分享】使用cubegen程序做分子的total electronic densities 已有6人参与

1.将你计算结果的chk文件转换成fchk文件
2.在linux和windows下运行cubegen
3.执行cubegen  0  density=scf  file.fchk  file.cube
4. SCF密度和总电子密度在进行HF计算和DFT计算时是一样的
5.使用gaussianview打开file.cube文件得到分子的总电子密度图
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lb1586551

铜虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):已经很具体了,这个操作不难吧!!! 2010-08-13 14:34:57
最好具体点,给点例子
2楼2010-08-13 13:27:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kingwater

金虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
已经写得非常详细了啊
3楼2010-08-13 16:45:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by miaoskypop at 2010-08-13 11:31:03:
1.将你计算结果的chk文件转换成fchk文件
2.在linux和windows下运行cubegen
3.执行cubegen  0  density=scf  file.fchk  file.cube
4. SCF密度和总电子密度在进行HF计算和DFT计算时是一样的
5.使用gaussianvie ...

出来的等值面图是紫色的,正常吗?
4楼2011-03-04 23:01:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
electronic densities 的值都只是正值,等值面图是紫色的就是表达都是正值,是正常的。
5楼2011-03-05 07:28:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luolun2008

至尊木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhou2009 at 2011-03-05 07:28:43:
electronic densities 的值都只是正值,等值面图是紫色的就是表达都是正值,是正常的。

请问您一下,用中性的电子密度减去阳离子的电子密度,得到的蓝色和紫色的又表示什么呢?谁是正,谁是负?
尘埃落定之前,一切皆有可能!!!
6楼2011-10-30 15:30:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by luolun2008 at 2011-10-30 15:30:01:
请问您一下,用中性的电子密度减去阳离子的电子密度,得到的蓝色和紫色的又表示什么呢?谁是正,谁是负?

用中性的电子密度减去阳离子的电子密度,得到的是密度差,它表明,中性的变为阳离子,什么部位电荷减少(蓝色)了,什么部位电荷增加(紫色)了。蓝色和紫色仅表示电子密度发生的变化,不代表通常意义上的正负电荷。
7楼2011-10-30 16:30:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luolun2008

至尊木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by zhou2009 at 2011-10-30 16:30:56:
用中性的电子密度减去阳离子的电子密度,得到的是密度差,它表明,中性的变为阳离子,什么部位电荷减少(蓝色)了,什么部位电荷增加(紫色)了。蓝色和紫色仅表示电子密度发生的变化,不代表通常意义上的正负电 ...

谢谢您,您讲的很明白,很受用。
尘埃落定之前,一切皆有可能!!!
8楼2011-10-31 09:04:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

54snail

银虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
问一下,windows 下怎么操作的
9楼2015-01-24 15:57:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 miaoskypop 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +3 wangyl_123 2026-10-10 6/300 2026-10-11 15:04 by Abin0406
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +3 好运来~9527 2026-10-10 5/250 2026-10-11 09:00 by 好运来~9527
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见