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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【请教】请教缺省值问题
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日不落

金虫 (著名写手)

[交流] 【请教】请教缺省值问题

在解晶体结构时，给重原子加氢，如N，C上理论加氢，在cif文件中，发现H的坐标都没有误差值，如：
N1 N -0.1359(4) 0.4694(2) 0.43137(18) 0.0618(8) Uani 1 1 d . . .
H1A H -0.2082 0.4221 0.4555 0.074 Uiso 1 1 calc R . .
H1B H -0.1923 0.5267 0.4143 0.074 Uiso 1 1 calc R . .
而手动给水上的O加氢，在cif文件中H的坐标有误差值的，请问这是怎么回事？望指点该怎么办，谢谢！
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1楼 2010-08-10 14:44:15
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
日不落(金币+5):谢谢 2010-08-12 08:52:04
引用回帖:
Originally posted by 日不落 at 2010-08-11 11:16:22:

如果试试这个damp命令怎么操作呢？谢谢赐教

就是在INS文件里面加入DAMP 后面加一个数，一般是300~2000吧，这个数越大你的误差越小，但好像主要用于键长的，我也不是很了解~
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学无止境
8楼2010-08-11 23:27:18
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
日不落(金币+2):我这个晶体是有机配体，但是另外的一个有机金属配合物理论加氢时，又有误差呀。而且这个解完后用checkcif检测时，出现错误，望继续交流，谢谢 2010-08-11 07:14:11
帝夫:感谢回帖交流！ 2010-08-11 09:37:46
我觉得理论加氢是由软件计算得到的结果，是理想的位置，所以没有误差，而你手动加上的氢并不是理想的位置，或者说不是有计算得到的，应该是有误差的~
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学无止境
2楼2010-08-10 22:26:00
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
帝夫:感谢回帖交流！ 2010-08-11 09:38:31
你是不是用damp命令了？
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学无止境
3楼2010-08-11 09:27:38
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帝夫

至尊木虫 (知名作家)

=一只小小啄木鸟=

优秀版主优秀版主
引用回帖:
Originally posted by cluster8676 at 2010-08-11 09:27:38:
你是不是用damp命令了？

有这个命令吗？呵呵，望指教~~
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万俗皆走圆，一生尤学方！
4楼2010-08-11 09:39:07
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