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风间的记忆铁杆木虫 (著名写手)
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【原创】买了Infiniband,实际上并没有用到Infiniband你知道吗?已有8人参与
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现在的集群建设都喜欢上Infiniband,这代表着专业和高速,但很少有人知道实际 上大多数计算软件并不支持Infiniband的协议,实际上投入了大量资金却没有真正的利 用起来。 以需要编译的VASP为例,但如果并行环境非支持Infiniband或者编译的时候不加入 Infiniband参数,就无法走Infiniband本身的协议,走的是IP OVER IB的协议。 那我们再解释下什么是Infiniband协议和IP OVER IB的区别? ① Infiniband网络可以看成高速公路,而采用Infiniband协议就好比使用奔驰车运送数据,而采用IP OVER IB 就好比使用QQ运送数据(这个比较可能不太贴切,速度快慢除了和协议有关还和计算机网络中很多底层东西相关,很难一句两句解释清楚) ②因为TCP/IP是非可靠协议,所以传输的数据有大量的校验信息,而Infiniband协议是可靠协议,校验信息比较少。这样同样运载能力的一辆车,运输TCP/IP协议的数据包的时候真正数据只有70%,而运输Infiniband协议的数据包的时候真正的数据可以是95%。 至于如何判断是否走Infiniband本身的协议比较复杂,比较表面化的就是在MPIRUN运行VASP此类程序时是否加入IB的协议或者安装的是否支持Infiniband协议的MPI版本(MPICH肯定是不支持的)。 而另外一些比如FLUENT等商业软件也同样需要做开发才能支持IB本身的协议。 抛砖引玉,以待来人! |
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wangyujia
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7楼2010-09-03 10:00:57
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