应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】gaussian中简正坐标的输出
51/1返回列表
查看: 1646  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

tiancj

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】gaussian中简正坐标的输出 已有2人参与

在一篇文章《Vibrational Analysis in Gaussian》中说到“The purpose of this document is to describe how Gaussian calculates the reduced mass, frequencies, force constants, and normal coordinates which are printed out at the end of a frequency calculation.”从这句话看normal coordinates应该在计算频率的时候打印出来了啊，可是不知道哪地方给的是normal coordinates？以H2o为例，计算频率时的部分输出为：
(Enter /home/gau03/g03/l716.exe)
Dipole        =-3.44478646D-17-3.96506834D-17-6.72452773D-01
Polarizability= 4.00613449D-02 3.18281559D-16 5.50808430D+00
                 1.58802971D-16 1.97181875D-16 2.56587227D+00
HyperPolar    =-3.59200065D-17-6.27316867D-18-2.96845704D-16
                -1.10949459D-14 7.62420726D-02-3.00230546D-16
                -7.01237208D+00-1.56024452D-16 2.91713493D-15
                -4.11420102D+00
Full mass-weighted force constant matrix:
Low frequencies ---   -6.0514   -1.0843   -0.0019   -0.0012   -0.0009    4.5788
Low frequencies --- 2170.0372 4140.0019 4391.0737
Diagonal vibrational polarizability:
        0.0000000       0.0418305       0.1108974
Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole), Raman scattering
activities (A**4/AMU), depolarization ratios for plane and unpolarized
incident light, reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A),
and normal coordinates:（这里也显示normal coordinates，但是不知道怎么看，我怎么找不到啊？
                     1                      2                      3
                    A1                     A1                     B2
Frequencies --  2170.0372              4140.0019              4391.0737
Red. masses --     1.0785                 1.0491                 1.0774
Frc consts  --     2.9923                10.5941                12.2392
IR Inten    --     7.2379                44.2862                29.9710
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   1     0.00   0.45   0.54     0.00  -0.57   0.42     0.00   0.54  -0.45
   2   1     0.00  -0.45   0.54     0.00   0.57   0.42     0.00   0.54   0.45
   3   8     0.00   0.00  -0.07     0.00   0.00  -0.05     0.00  -0.07   0.00
谢谢指点。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

量化 Gaussian

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-01 15:53:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiancj

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-08-02 18:24:03:
若不考虑质权、笛卡尔-内坐标转换这些细节问题，L就是Hessian矩阵的本征向量矩阵，也就是Vibrational Analysis in Gaussian的公式7。

关于变换关系的细节问题在Vibrational Analysis in Gaussian里面都详细说明。

谢谢！
回复此楼
9楼2010-08-07 00:15:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★
tiancj(金币+5): 2010-08-01 16:21:00
zhou2009(金币+3): 2010-09-23 16:43:18
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   1     0.00   0.45   0.54     0.00  -0.57   0.42     0.00   0.54  -0.45
   2   1     0.00  -0.45   0.54     0.00   0.57   0.42     0.00   0.54   0.45
   3   8     0.00   0.00  -0.07     0.00   0.00  -0.05     0.00  -0.07   0.00
这个就是。例如2号原子的X,Y,Z坐标构成第1种简正坐标的系数为0.00 -0.45 0.54。
你把这里每个振动模式的3*3矩阵排列成9*1就容易看出简正坐标与原先3N坐标的关系了。如第一个简正坐标：
0.00
0.45
0.54
0.00
-0.45
0.54
0.00
0.00
-0.07

[ Last edited by sobereva on 2010-8-1 at 16:18 ]
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-08-01 16:04:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiancj

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-08-01 16:04:47:
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   1     0.00   0.45   0.54     0.00  -0.57   0.42     0.00   0.54  -0.45
   2   1     0.00  -0.45   0.54     0.00   ...

这里是简正坐标吗？这不是振动模式1下振动时原子2在x，y，z方向的变化量吗？感觉这是笛卡尔坐标啊?!谢谢你的帮助!
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-01 16:26:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★
tiancj(金币+5): 2010-08-01 23:21:52
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！！ 2010-08-02 08:26:03
简正振动坐标和原始3N个笛卡尔坐标是一个线性变换的关系，前者可写为后者的线性组合。每个振动模式对应一简正坐标，由于简正坐标在每个原子笛卡尔坐标上都有分量，所以振动自然会体现在原子笛卡尔坐标的变化上。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-08-01 17:01:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856求调剂 +3 zhn03 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:02 by Ainin_
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:38 by cocolv
[考研] 282求调剂 +3 wcq131415 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:16 by userper
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 一志愿吉林大学材料与化工303分求调剂 +4 为学666 2026-03-24 4/200 2026-03-25 11:27 by BruceLiu320
[考研] 287求调剂 +10 晨昏线与星海 2026-03-19 11/550 2026-03-25 10:35 by userper
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +10 纸鱼ly 2026-03-21 11/550 2026-03-24 17:22 by qingfeng258
[考博] 申博26年 +4 八6八68 2026-03-19 4/200 2026-03-24 15:49 by 小Ben呵呵
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-24 5/250 2026-03-24 15:46 by 星空星月
[考研] 277分求调剂，跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 316求调剂 +7 梁茜雯 2026-03-19 7/350 2026-03-23 16:21 by lingjue
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
[考研] 考研调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭