应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】gaussian中简正坐标的输出
51/1返回列表
查看: 1651  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

tiancj

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】gaussian中简正坐标的输出 已有2人参与

在一篇文章《Vibrational Analysis in Gaussian》中说到“The purpose of this document is to describe how Gaussian calculates the reduced mass, frequencies, force constants, and normal coordinates which are printed out at the end of a frequency calculation.”从这句话看normal coordinates应该在计算频率的时候打印出来了啊，可是不知道哪地方给的是normal coordinates？以H2o为例，计算频率时的部分输出为：
(Enter /home/gau03/g03/l716.exe)
Dipole        =-3.44478646D-17-3.96506834D-17-6.72452773D-01
Polarizability= 4.00613449D-02 3.18281559D-16 5.50808430D+00
                 1.58802971D-16 1.97181875D-16 2.56587227D+00
HyperPolar    =-3.59200065D-17-6.27316867D-18-2.96845704D-16
                -1.10949459D-14 7.62420726D-02-3.00230546D-16
                -7.01237208D+00-1.56024452D-16 2.91713493D-15
                -4.11420102D+00
Full mass-weighted force constant matrix:
Low frequencies ---   -6.0514   -1.0843   -0.0019   -0.0012   -0.0009    4.5788
Low frequencies --- 2170.0372 4140.0019 4391.0737
Diagonal vibrational polarizability:
        0.0000000       0.0418305       0.1108974
Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole), Raman scattering
activities (A**4/AMU), depolarization ratios for plane and unpolarized
incident light, reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A),
and normal coordinates:（这里也显示normal coordinates，但是不知道怎么看，我怎么找不到啊？
                     1                      2                      3
                    A1                     A1                     B2
Frequencies --  2170.0372              4140.0019              4391.0737
Red. masses --     1.0785                 1.0491                 1.0774
Frc consts  --     2.9923                10.5941                12.2392
IR Inten    --     7.2379                44.2862                29.9710
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   1     0.00   0.45   0.54     0.00  -0.57   0.42     0.00   0.54  -0.45
   2   1     0.00  -0.45   0.54     0.00   0.57   0.42     0.00   0.54   0.45
   3   8     0.00   0.00  -0.07     0.00   0.00  -0.05     0.00  -0.07   0.00
谢谢指点。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

量化 Gaussian

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-01 15:53:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiancj

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-08-01 16:04:47:
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   1     0.00   0.45   0.54     0.00  -0.57   0.42     0.00   0.54  -0.45
   2   1     0.00  -0.45   0.54     0.00   ...

这里是简正坐标吗？这不是振动模式1下振动时原子2在x，y，z方向的变化量吗？感觉这是笛卡尔坐标啊?!谢谢你的帮助!
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-01 16:26:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★
tiancj(金币+5): 2010-08-01 16:21:00
zhou2009(金币+3): 2010-09-23 16:43:18
Atom AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
   1   1     0.00   0.45   0.54     0.00  -0.57   0.42     0.00   0.54  -0.45
   2   1     0.00  -0.45   0.54     0.00   0.57   0.42     0.00   0.54   0.45
   3   8     0.00   0.00  -0.07     0.00   0.00  -0.05     0.00  -0.07   0.00
这个就是。例如2号原子的X,Y,Z坐标构成第1种简正坐标的系数为0.00 -0.45 0.54。
你把这里每个振动模式的3*3矩阵排列成9*1就容易看出简正坐标与原先3N坐标的关系了。如第一个简正坐标：
0.00
0.45
0.54
0.00
-0.45
0.54
0.00
0.00
-0.07

[ Last edited by sobereva on 2010-8-1 at 16:18 ]
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-08-01 16:04:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★
tiancj(金币+5): 2010-08-01 23:21:52
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！！ 2010-08-02 08:26:03
简正振动坐标和原始3N个笛卡尔坐标是一个线性变换的关系，前者可写为后者的线性组合。每个振动模式对应一简正坐标，由于简正坐标在每个原子笛卡尔坐标上都有分量，所以振动自然会体现在原子笛卡尔坐标的变化上。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-08-01 17:01:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiancj

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-08-01 17:01:37:
简正振动坐标和原始3N个笛卡尔坐标是一个线性变换的关系，前者可写为后者的线性组合。每个振动模式对应一简正坐标，由于简正坐标在每个原子笛卡尔坐标上都有分量，所以振动自然会体现在原子笛卡尔坐标的变化上。

谢谢！那这里的0.00 -0.45 0.54等指的是前者（简正坐标）还是后者（笛卡尔坐标）啊？输出结果里能不能前者后者都看到呢？或者是看到具体怎么变换的吗？
赞一下 回复此楼
5楼2010-08-01 23:34:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +3 芦lty 2026-03-25 4/200 2026-03-25 23:25 by 芦lty
[考研] 308求调剂 +5 墨墨漠 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:19 by 544594351
[考研] 292求调剂 +6 鹅鹅鹅额额额额� 2026-03-25 7/350 2026-03-25 22:04 by 无际的草原
[考研] 086000生物与医药292求调剂 +4 小小陈小小 2026-03-22 7/350 2026-03-25 19:07 by 星空星月
[考研] 招08考数学 +8 laoshidan 2026-03-20 17/850 2026-03-25 17:52 by 一个红太阳
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:29 by 2177681040
[考研] 材料与化工考研调剂 +9 孅華 2026-03-22 9/450 2026-03-25 13:09 by cmz0325
[考研] 材料学硕，求调剂 6+4 糖葫芦888ll 2026-03-22 9/450 2026-03-25 11:19 by greychen00
[考研] 07化学280分求调剂 +7 722865 2026-03-23 7/350 2026-03-25 09:29 by aa331100
[考研] B区考研调剂 +4 yqdszhdap－ 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:51 by baoball
[考研] 070300化学求调剂 +9 苑豆豆 2026-03-20 9/450 2026-03-24 17:15 by licg0208
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考研] 292求调剂 +4 鹅鹅鹅额额额额� 2026-03-24 4/200 2026-03-24 16:41 by peike
[考研] 276求调剂 +3 YNRYG 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:31 by 醉在风里
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +4 石瑞0426 2026-03-19 4/200 2026-03-22 08:50 by Wei_ren
[考研] 一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 288求调剂 +16 于海海海海 2026-03-19 16/800 2026-03-20 22:28 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭