24小时热门版块排行榜    

查看: 3513  |  回复: 15

cxbaoa

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求助一个药物的晶体结构数据! 已有8人参与


环孢素A

菜鸟求助!不是搞晶体的,不知道怎么查!目的是想画出结构图来。(也是请别人画)
直接给我结果就行!求助大家!
回复此楼
淡淡欢喜淡淡愁
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

heyan1602

金虫 (正式写手)


cxbaoa(金币+2):谢谢参与
cxbaoa(金币+1):谢谢,环孢素C62H111N11O12 M=1202.63 2010-07-28 14:31:54
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-28 14:42:08
你把药物的化学式写出来吧!
2楼2010-07-28 11:13:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11900490

木虫 (知名作家)

★ ★
cxbaoa(金币+2):谢谢参与
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-07-28 11:58:13
将CCDC发到有机版块是为了有机虫子可以看看,下载!

这是CCDC主数据库文件下载链接,一共281M。
http://www.namipan.com/d/CCDC%e4 ... c654d317e5723d28f11
http://www.namipan.com/d/CCDC%e4%b8%bb%e6%95%b0%e6%8d%ae%e5%ba%93%e6%96%87%e4%bb%b6.rar/c4804965229a163a3be6e04454bf3c654d317e5723d28f11





另外主程序下载地址是(注意,主程序这里面没有数据库文件及其升级包。也就是说D:\Program Files\CCDC\ConQuest 1.3\csd1是空的。只要将CCDC主数据库文件以及升级包文件拷贝到这个目录下面就可以了。)
http://ishare.iask.sina.com.cn/f/6589897.html
http://ishare.iask.sina.com.cn/f/6589897.html






关于升级包的下载可以到这个新浪资料共享目录下面。
http://iask.sina.com.cn/u/113394 ... id=52196&page=0
http://iask.sina.com.cn/u/1133949350/ish?folderid=52196&page=0
3楼2010-07-28 11:19:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11900490

木虫 (知名作家)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-28 14:42:58
这是CCDC你自己下载然后自己查吧
4楼2010-07-28 11:20:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11900490

木虫 (知名作家)

★ ★
yanhualover(金币+2):谢谢交流 2010-07-28 11:57:57
从CCDC导出的CIF文件,画出ChemDraw图的方法。这样可以确保得到的图是正确的图,必要的检查是可取的。这样得到的图来自单晶的实验数据,具有权威性。


CCDC输出CIF文件


输出1.CIF文件


用XSHELL打开1.cif文件。


用XSHELL打开1.cif文件会出现错误提示


打开CIF文件格式


XSHELL打开的cif文件


选择H


杀掉H


双键


另存为CT文件


保存为CT格式文件


ChemDraw打开CT文件



压扁得到想要的结构图


得到的结构图
5楼2010-07-28 11:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11900490

木虫 (知名作家)

6楼2010-07-28 11:33:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11900490

木虫 (知名作家)

7楼2010-07-28 11:33:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11900490

木虫 (知名作家)

★ ★ ★
yanhualover(金币+3):谢谢交流 2010-07-28 11:57:16
对熟悉CCDC的都知道CCDC检索的方便,
这里我对自己最近的“再发现”的CCDC检索作者给以实例。让不熟悉CCDC的有机化学家门也能了解CCDC。使用CCDC帮助科研!





这是作者搜索框      


点击图中黑框标出的"Author/Journals"得到下图所示的画面


这就是作者搜索框,这里面有很多选项我们主要介绍一下作者名字和时间限定。下面我们以下面的新闻里面的人名作为搜索的对象


Menahem Kaftory,搜索词是M.Kaftory,这是规定的,注意中间没有空格


看到了吗,我们输入在作者框里面的词是M.Kaftory        


我们可以限定时间,这里我们看看作者在2009年都发表了什么


搜索结果:2009年Menahem Kaftory有 31 个晶体结构


另外一个方法是:不限定搜索年份,我们选择数据库年份,如图我们看到数据库是主数据库+25升级包.这时我们点掉前面的勾,得到下面的图


这时候我们看不到单独的数据库,需要点击上面的“单独显示数据库升级包选项”        



这时候我们看到各个升级包选项,我们可以点选各个数据库升级包。如图我们选择了三个升级包选项


搜索结构要少一些,只有12个晶体结构。













  CCDC主程序(没有数据库文件)http://ishare.iask.sina.com.cn/f/6589897.html      



这是CCDC主数据库文件下载链接,一共281M。
http://www.namipan.com/d/CCDC%e4 ... c654d317e5723d28f11



另外主程序下载地址是(注意,主程序这里面没有数据库文件及其升级包。也就是说D:\Program Files\CCDC\ConQuest 1.3\csd1是空的。只要将CCDC主数据库文件以及升级包文件拷贝到这个目录下面就可以了。)
http://ishare.iask.sina.com.cn/f/6589897.html
http://www.namipan.com/d/CCDC%e4%b8%bb%e6%95%b0%e6%8d%ae%e5%ba%93%e6%96%87%e4%bb%b6.rar/c4804965229a163a3be6e04454bf3c654d317e5723d28f11



关于升级包的下载可以到这个新浪资料共享目录下面。
http://iask.sina.com.cn/u/113394 ... id=52196&page=0
8楼2010-07-28 11:34:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzyou2008

木虫 (正式写手)

小木虫之小药虫

★ ★
cxbaoa(金币+2):谢谢参与
cxbaoa(金币+1):谢谢 2010-07-28 15:13:24
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-07-28 16:08:42
引用回帖:
Originally posted by cxbaoa at 2010-07-28 09:57:51:

环孢素A

菜鸟求助!不是搞晶体的,不知道怎么查!目的是想画出结构图来。(也是请别人画)
直接给我结果就行!求助大家!

下面的连接中,有你要的东西。PS: 你上面画的不是环孢素A!!!
http://d.namipan.com/d/deadf422d ... 8a9778340cdacb90000
随遇而安!
9楼2010-07-28 12:49:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11900490

木虫 (知名作家)

★ ★ ★
cxbaoa(金币+10):非常感谢! 2010-07-28 14:34:53
wsht212(金币+3):谢谢交流,希望常来! 2010-07-28 16:09:16
我给你搜索了一下发现有14个结果。
我把大体的搜索过程给你用快照弄下来了。你看看!搜索结果在附件里面,你可以下载文献

图片0:“环孢素A”的附件内容。
http://www.namipan.com/d/%e7%8e%af%e5%ad%a2%e7%b4%a0A.rar/fb7465043a19b1d51828e9ce52ca6881e951b473f6bf0000




下面是大体过程,图片下面有说明。


图片1:用搜索引擎找到“环孢素A”的英文名称“Cyclosporin A”


图片2:打开CCDC。然后选择“Compound Name”来搜索环孢素A。


图片3:在“Compound Name”框里面填上环孢素A的英文名称“Cyclosporin A”。


图片4:选择数据库,可以不用管这个。默认就行。


图片5:搜索结果一共14个。


图片6:我们用3维视图看看结果,非常漂亮!我们再用上面帖子提到的方法把结果导出来。然后用XSHELL来看并且导出为ChemDraw可以认识的CT格式。以便于ChemDraw编辑


图片7:用XSHELL来看并且导出为ChemDraw可以认识的CT格式。以便于ChemDraw编辑


图片8:ChemDraw编辑效果图。你可以根据需要来对取代基和官能团进行编辑

[ Last edited by 11900490 on 2010-7-28 at 14:15 ]
10楼2010-07-28 13:27:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cxbaoa 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然评审意见 +7 wangmingqi 2026-08-28 8/400 2026-08-28 18:42 by zhuzg0628
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 17:09 by winsaint
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +11 Kittylucky 2026-08-27 12/600 2026-08-28 16:26 by lyxiaomc
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见