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flychang0506

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】求助:基于连锁不平衡原理的关联分析中的一些问题

各位虫友,大家好:
    基于连锁不平衡的关联分析是数量性状位点挖掘的重要手段之一。在基于连锁不平衡的关联分析(LD-association)中,有几个问题不明白,想请高手指点一下。

一个就是在基于全基因组扫描的时候,参考文献上的群体一般都是品种、品系,在不同属间、种间材料(群体很大)上是否可以运用LD-association方法

另一个就是,在标记类型的选择上,现有文献一般都是基因组信息比较丰富的水稻、小麦、玉米、大豆、油菜等大田作物,多数利用的也都是基于序列的共显性标记,有少数用AFLP。我想问的是,显性标记(RAPD、ISSR、SRAP等)可以用于LD-association中吗,会产生何种影响?
   
    以上问题,还请各位高手不吝赐教,万分感谢!
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