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flychang0506

木虫 (著名写手)

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[交流] 【求助】求助：基于连锁不平衡原理的关联分析中的一些问题

各位虫友，大家好：
基于连锁不平衡的关联分析是数量性状位点挖掘的重要手段之一。在基于连锁不平衡的关联分析（LD-association)中，有几个问题不明白，想请高手指点一下。

一个就是在基于全基因组扫描的时候，参考文献上的群体一般都是品种、品系，在不同属间、种间材料（群体很大）上是否可以运用LD-association方法？

另一个就是，在标记类型的选择上，现有文献一般都是基因组信息比较丰富的水稻、小麦、玉米、大豆、油菜等大田作物，多数利用的也都是基于序列的共显性标记，有少数用AFLP。我想问的是，显性标记（RAPD、ISSR、SRAP等）可以用于LD-association中吗，会产生何种影响？

以上问题，还请各位高手不吝赐教，万分感谢！

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