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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】用CASTEP计算晶体时结构问题
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viplaji006

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用CASTEP计算晶体时结构问题已有5人参与

小弟有两个问题需要向各位请教：

        1. 用CASTEP计算晶体的时候，  可以直接用文献中实验用XRD确定出的晶体结构（不进行结构优化） 来进行计算，      还是用实验确定的结构，但是还要进行结构优化？  （最好简单解释一下原因）

          2. 有CASTEP 或者Dmol3计算单个分子的带电状态（比如C60分子的-1价，-2价），这种怎么来计算？  直接计算的时候charge 那里改成相应的值，还是有其他注意的？（这里的charge是改的什么东西）  

       谢谢各位不吝赐教！

[ Last edited by viplaji006 on 2010-7-18 at 09:31 ]
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Justdoit
1楼2010-07-18 09:29:53
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condensed

木虫 (著名写手)
★ ★
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lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-07-18 10:27:19
1.结构优化.实验体系和理想体系的差别.
2。不懂.
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2楼2010-07-18 09:36:58
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viplaji006

木虫 (小有名气)
非常感谢您的回复。

实验体系和理想体系的差别，这个还是有点模糊，能否再具体的讲一下。谢谢！
引用回帖:
Originally posted by condensed at 2010-07-18 09:36:58:
1.结构优化.实验体系和理想体系的差别.
2。不懂.

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Justdoit
3楼2010-07-18 09:54:39
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condensed

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
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lvjian8596(金币+2):感谢交流！ 2010-07-18 10:27:35
理想体系考虑不到缺陷,杂质,位错,温度等等一系列能影响到晶体能量的因素.因此理论上找到的能量最低点往往和实验有微弱的差别,需重新结构优化.
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4楼2010-07-18 10:06:41
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★ ★ ★
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lvjian8596(金币+2):感谢交流！ 2010-07-18 10:42:00
1。需要优化。以实验值为初始结构优化快（优化出的结构应该跟实验值很接近），DFT讨论的是体系的基态，所以需要优化找到能量最低。


2。charge 那里直接改成相应的值，对的。
     这是阴离子的计算。通常跟中性分子/团簇比较，计算电子亲和势。。。


供参考。
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5楼2010-07-18 10:30:34
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viplaji006

木虫 (小有名气)
恩，懂您的意思啦，谢谢！

嘿嘿，谢谢指点~~~
引用回帖:
Originally posted by condensed at 2010-07-18 10:06:41:
理想体系考虑不到缺陷,杂质,位错,温度等等一系列能影响到晶体能量的因素.因此理论上找到的能量最低点往往和实验有微弱的差别,需重新结构优化.

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Justdoit
6楼2010-07-18 10:53:06
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viplaji006

木虫 (小有名气)
谢谢您的指点，非常感谢！
很有道理~
引用回帖:
Originally posted by fzx2008 at 2010-07-18 10:30:34:
1。需要优化。以实验值为初始结构优化快（优化出的结构应该跟实验值很接近），DFT讨论的是体系的基态，所以需要优化找到能量最低。


2。charge 那里直接改成相应的值，对的。
     这是阴离子的计算。通常跟 ...

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Justdoit
7楼2010-07-18 10:53:51
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viplaji006

木虫 (小有名气)
不好意思，就第二个问题再向您请教：

比如阴离子的话， 加上电子后，计算的时候对称性啥的需要考虑不？
多余的这个电子在计算时，是如何考虑进去的？
引用回帖:
Originally posted by fzx2008 at 2010-07-18 10:30:34:
1。需要优化。以实验值为初始结构优化快（优化出的结构应该跟实验值很接近），DFT讨论的是体系的基态，所以需要优化找到能量最低。


2。charge 那里直接改成相应的值，对的。
     这是阴离子的计算。通常跟 ...

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Justdoit
8楼2010-07-18 10:58:44
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carlaty

金虫 (正式写手)
★ ★
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lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-07-18 19:13:15
对于charge这一选项记得有个很有意思的事情就是
加上了到底有意义没有
对一个晶格加上电荷，则体系带电，进一步则意味着晶格间带同种电荷相互排斥，这进一步意味着什么我就不知了，呵呵。
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9楼2010-07-18 19:12:01
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yjmaxpayne

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
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hedaors(金币+2):Thanks 2010-07-19 15:21:35
1. 一般来说， 你得做多手打算， 一方面是对未优化（实验）结构进行性质的计算， 例如能量， 能带结构， DOS，光学性质等，以便能够和其他实验结果进行对比。

另外就是考虑保持实验晶格常数，然后再进行原子占位的优化，这个时候通常是得考虑从P1对称性开始优化， 然后看原子占位是否会发生大的变动，并且通过Find Symmetry工具来确认晶格对称性。如果相比优化之前变化不大， 那么可以确定实验的结构和理论结构是基本一致的。

再者就是考虑包含了晶格常数的优化，这个时候因为有泛函的影响， 例如LDA会低估晶格常数， GGA通常会高估晶格常数， 假设你优化后的结构相比实验结构变化不是很大， 那么就可以很放心的进行下一步性质的计算。 但是通常来说， 因为结构存在许多的局域最小， 优化不一定会让你得到实验中的那个结构， 这个时候就需要格外的注意晶格，原子占位以及对称性发生的变化了。

2. 推荐使用DMol进行单分子的带点计算， CASTEP可用，但是晶格得足够的大，并且晶格中只有一个分子， 以消除相邻晶格间的静电相互作用。 另外，通常意义上的晶格是电中性的， 在计算中，电荷的处理得十分的谨慎。
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10楼2010-07-19 11:01:29
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