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汕头大学海洋科学、生物学、生物与医药等3个专业接受调剂
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wyw3785492

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】cif文件的填写问题已有11人参与

各位好,第一次填写cif文件,不知道去哪里找要填的信息,
_cell_measurement_reflns_used     ?
_cell_measurement_theta_min     ?
_cell_measurement_theta_max     ?
_exptl_absorpt_process_details      ?
_exptl_absorpt_correction_T_min   ?
_exptl_absorpt_correction_T_max   ?

_diffrn_detector_area_resol_mean  ?
_diffrn_standards_number          ?
_diffrn_standards_interval_count  ?
_diffrn_standards_interval_time   ?
_diffrn_standards_decay_%         ?

上面问号的答案不知道哪里去找,请大家帮忙,谢谢大家。
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knight1014

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
wyw3785492(金币+14):辛苦了。谢谢 2010-07-09 15:43:18
yanhualover(金币+2):谢谢交流 2010-07-09 18:54:24
data_NJU

_audit_creation_method       SHELXL-97   产生CIF的程序名称
_chemical_name_systematic                 化合物的系统命名
;
?
;
_chemical_name_common          ?       化合物的俗名
_chemical_melting_point           ?       化合物的熔点
_chemical_formula_moiety         
'C15 H13 N3 O'                          化合物的化学式
_chemical_formula_sum
'C15 H13 N3 O'
_chemical_formula_weight          251.28   化合物的化学式量

loop_
_atom_type_symbol                       构成化合物的原子散射因子来源
_atom_type_description
_atom_type_scat_dispersion_real
_atom_type_scat_dispersion_imag
_atom_type_scat_source
'C'  'C'   0.0033   0.0000
'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
'H'  'H'   0.0000   0.0000
'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
'N'  'N'   0.0061   0.0000
'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
'O'  'O'   0.0106   0.0000
'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'

_symmetry_cell_setting           'Triclinic'        晶系名称
_symmetry_space_group_name_H-M   'Pc   '       空间群名称

loop_
_symmetry_equiv_pos_as_xyz                    
'x, y, z'
'x, -y, z+1/2'                                   晶胞中等效坐标

_cell_length_a                    12.608(8)      晶胞参数
_cell_length_b                    11.023(7)
_cell_length_c                    10.044(7)
_cell_angle_alpha                 90.00
_cell_angle_beta                  105.94(3)
_cell_angle_gamma                 90.00
_cell_volume                      1342.2(15)
_cell_formula_units_Z             4
_cell_measurement_temperature     291(2)   测量晶胞时的温度
_cell_measurement_reflns_used     940     用于确定晶胞的衍射点数     
_cell_measurement_theta_min       2.50    用于确定晶胞的衍射点的最小θ值  
_cell_measurement_theta_max       20.48   用于确定晶胞的衍射点的最大θ值   以上三项在*.ls中的后面找。

_exptl_crystal_description        block     被测单晶的外观形状
_exptl_crystal_colour            colourless 被测单晶的外观颜色
_exptl_crystal_size_max           0.30    被测单晶的外观尺寸
_exptl_crystal_size_mid           0.26
_exptl_crystal_size_min           0.24
_exptl_crystal_density_meas       ?         被测单晶的测量密度
_exptl_crystal_density_diffrn     1.244       被测单晶的计算密度
_exptl_crystal_density_method     'not measured' 测量单晶密度方法
_exptl_crystal_F_000              528        单胞中电子数
_exptl_absorpt_coefficient_mu     0.081        单胞的线性吸收系数
_exptl_absorpt_correction_type    'multi-scan'    吸收校正方法 )
_exptl_absorpt_correction_T_min   0.98         最小透过率
_exptl_absorpt_correction_T_max   0.98         最大透过率
_exptl_absorpt_process_details    'SADABS; Bruker, 2000'  吸收校正所用方法及其文献

_exptl_special_details;

?                   (实验细节描述)
;

_diffrn_ambient_temperature       291(2)    衍射实验时温度
_diffrn_radiation_wavelength      0.71073    衍射线波长λ
_diffrn_radiation_type           'MoK\a'     衍射光源
_diffrn_radiation_source         'sealed tube'  X-光管类型
_diffrn_radiation_monochromator  'graphite'    单色器类型
_diffrn_measurement_device_type  'Bruker Smart Apex CCD area detector' 衍射仪型号
_diffrn_measurement_method       'phi and omega scans' 收集衍射数据的方式
_diffrn_detector_area_resol_mean  ?
_diffrn_standards_number          ? 设置标准衍射点数
_diffrn_standards_interval_count  ?   标准衍射测量衍射点间隔
_diffrn_standards_interval_time   ?   标准衍射测量时间间隔
_diffrn_standards_decay_%         ? 测量过程中是否有衰减
_diffrn_reflns_number             11645 总衍射点数
_diffrn_reflns_av_R_equivalents   0.0437 等效点平均标准误差
_diffrn_reflns_av_sigmaI/netI     0.0321 平均背景强度与平均衍射强度之比
_diffrn_reflns_limit_h_min        -16  衍射指标范围
_diffrn_reflns_limit_h_max        16
_diffrn_reflns_limit_k_min        -13
_diffrn_reflns_limit_k_max        14
_diffrn_reflns_limit_l_min        -13
_diffrn_reflns_limit_l_max        12
_diffrn_reflns_theta_min          1.68   结构精修时最小θ角
_diffrn_reflns_theta_max     27.74  结构精修时最大θ角
_reflns_number_total        3110  独立衍射点数
_reflns_number_gt          2784  独立衍射点中强度大于2σ的衍射点数
_reflns_threshold_expression      >2sigma(I)

_computing_data_collection      'SMART (Bruker, 2000)' 收集衍射数据所用程序
_computing_cell_refinement      'SMART'  精修晶胞参数所用程序
_computing_data_reduction       'SAINT (Bruker, 2000)' 衍射数据还原所用程序
_computing_structure_solution   'SHELXTL (Bruker, 2000)' 解析粗结构所用程序
_computing_structure_refinement 'SHELXTL'   结构精修所用程序
_computing_molecular_graphics   'SHELXTL' 发表论文作图所用程序
_computing_publication_material 'SHELXTL'   发表论文制作数据表格所用程序

[ Last edited by knight1014 on 2010-7-9 at 14:15 ]
5楼2010-07-09 14:14:23
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普通回帖

linhua0402313

版主 (文坛精英)

yunruirui:谢谢交流,希望常来 2010-07-09 13:12:09
wyw3785492(金币+2):谢谢 2010-07-09 15:41:32
如果你的原始文件中有crystalclear。cif文件,里面就有你要的信息
身在高山独抚琴,心随流水会知音
2楼2010-07-09 12:45:25
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸

wyw3785492(金币+2):谢谢 2010-07-09 15:41:52
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-09 19:59:30
那个可以在pcf文件里找到,
3楼2010-07-09 13:13:07
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myfantasy8

至尊木虫 (职业作家)

wyw3785492(金币+2):谢谢 2010-07-09 15:42:10
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-09 19:59:43
xcif时先选R后选T,可以自动填写一大部分!祝好运!
4楼2010-07-09 13:13:36
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congming

金虫 (正式写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-09 20:00:15
赞楼上,辛苦了!俺弄下来学习下!!
彼年豆蔻,谁许谁地老天荒!
6楼2010-07-09 14:36:44
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冷月8008

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-07-09 18:54:11
自己生成个tex文件,里面会有很多信息。原始PCF文件中也有一部分有用信息
7楼2010-07-09 16:44:03
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-09 20:00:32
引用回帖:
Originally posted by yunruirui at 2010-07-09 06:13:07:
那个可以在pcf文件里找到,

pcf文件是什么?是shelx生成的文件?
8楼2010-07-09 17:02:36
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pwanggg

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yunruirui:谢谢交流,希望常来 2010-07-10 12:24:25
引用回帖:
Originally posted by knight1014 at 2010-07-09 14:14:23:
data_NJU

_audit_creation_method       SHELXL-97   产生CIF的程序名称
_chemical_name_systematic                 化合物的系统命名
;
?
;
_chemical_name_common          ?       化合物的俗名 ...

超赞!
欢迎大家交流^_^
9楼2010-07-09 22:53:47
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yunruirui(金币+2):谢谢交流,希望常来 2010-07-10 12:24:12
引用回帖:
Originally posted by rain841230 at 2010-07-09 17:02:36:

pcf文件是什么?是shelx生成的文件?

pcf文件在你的work文件夹里面,是pcf格式的,你在收集数据的时候填入的晶体信息,以及其他一些有系统产生的信息都在pcf文件里面,你要将其中的一些信息填入cif文件

下面就是pcf文件了:
data_QZ06091t
_symmetry_cell_setting           'Monoclinic'
_symmetry_space_group_name_H-M   'P2(1)/c  '
_cell_measurement_temperature     294(2)
_cell_measurement_reflns_used    8211
_cell_measurement_theta_min        2.17
_cell_measurement_theta_max       27.59
_exptl_crystal_description       'Plate'
_exptl_crystal_colour            'Black'
_exptl_crystal_size_min          0.05
_exptl_crystal_size_mid          0.10
_exptl_crystal_size_max          0.30
_exptl_crystal_density_meas      0
_exptl_crystal_density_method    '?'
_exptl_absorpt_correction_type   'none'
_exptl_absorpt_correction_T_min  ?
_exptl_absorpt_correction_T_max  ?
_diffrn_ambient_temperature       294(2)
_diffrn_radiation_type           'MoK\a'
_diffrn_radiation_source         'sealed tube'
_diffrn_radiation_monochromator  'graphite'
_diffrn_measurement_device_type  'CCD area detector'
_diffrn_measurement_method       'phi and omega scans'
_diffrn_detector_area_resol_mean ?
_diffrn_standards_number         ?
_diffrn_standards_interval_count ?
_diffrn_standards_decay_%        ?
_computing_data_collection      'Bruker SMART'
_computing_cell_refinement      'Bruker SMART'
_computing_data_reduction       'Bruker SAINT'
_computing_structure_solution   'Bruker SHELXTL'
_computing_structure_refinement 'Bruker SHELXTL'
_computing_molecular_graphics   'Bruker SHELXTL'
_computing_publication_material 'Bruker SHELXTL'
学无止境
10楼2010-07-09 23:30:45
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