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staphlee

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】溶剂甲醇无序怎麼处理?? 已有3人参与

请教各位
我有个晶体溶剂分子无序
以下我简单的讲一下我指定的程序
在我把整个分子架构的原子指定完之后...
发现还有 Q1-Q2
在xp里面用grow指令
变成Q1-Q2-Q1A (看起来像一直线)
因为Q1和Q2的温度因子很高
所以想说可能是无序
然后我把
Q1指定为C24 (指定为24是我的晶体编号)
Q2指定为O3 (指定为3是我的晶体编号)
删掉Q1A
存档离开XP
在.ins加入anis O3, anis C24然后精修XL
然后打开.ins档案
C24 1 0.68620 0.41890 0.48970 11.00000 0.05000
O3 6 0.50000 0.50000 0.50000 10.50000 0.05000
        请问这里C24怎会是11.00000而O3怎会是10.50000??
之后打开.lst 档案..里面出现
0.2054 0.0658 0.0518 C24 may be split into 0.7124 0.4276 0.4899 and 0.6629 0.4178 0.4846
1.2781 0.0823 0.0584 O3 may be split into 0.5711 0.5182 0.5053 and 0.4289 0.4818 0.4947
之后回.ins档案修改为以下
PART 1
C24A 1 0.7124 0.4276 0.4899 21.00000 0.05000
O3A 6 0.5711 0.5182 0.5053 21.00000 0.05000
PART 2
C24B 1 0.6629 0.4178 0.4846 -21.00000 0.05000
O3B 6 0.4289 0.4818 0.4947 -21.00000 0.05000
PART 0
存档后精修xl...但是却出现以下讯息
**UNSET FREE VARIABLE FOR ATOM C24A**
可以请教各位高手教教我出了啥问题吗?
怎样才可以把我的无序处理好??
拜托了...感激不尽阿

[ Last edited by staphlee on 2010-7-10 at 13:58 ]
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triiawypm

银虫 (正式写手)


wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-07-09 08:35:54
staphlee(金币+3): 2010-07-09 11:17:24
INS文件里面FVAR那行, FVAR后面有一个数了已经, 需要再设置一个数儿, 就是所谓的FREE VARIABLE, 这个就是你PART 1的占有率初始值.
2楼2010-07-09 08:22:52
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staphlee

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by triiawypm at 2010-07-09 08:22:52:
INS文件里面FVAR那行, FVAR后面有一个数了已经, 需要再设置一个数儿, 就是所谓的FREE VARIABLE, 这个就是你PART 1的占有率初始值.

請問這個初始值要用多少呢??怎麼知道要用多少???哪裡可以查看??
3楼2010-07-09 11:18:15
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triiawypm

银虫 (正式写手)


yunruirui(金币+1):谢谢交流,希望常来 2010-07-09 13:10:17
staphlee(金币+3): 2010-07-09 13:19:26
引用回帖:
Originally posted by staphlee at 2010-07-09 11:18:15:


請問這個初始值要用多少呢??怎麼知道要用多少???哪裡可以查看??

你给一个即可, 书上说用0.6一般是合理的.
这个值会即着精修变动的.
4楼2010-07-09 13:08:33
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staphlee

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by triiawypm at 2010-07-09 13:08:33:


你给一个即可, 书上说用0.6一般是合理的.
这个值会即着精修变动的.

請問一下
C24 1 0.68620 0.41890 0.48970 11.00000 0.05000
O3 6 0.50000 0.50000 0.50000 10.50000 0.05000
        请问这里C24怎会是11.00000而O3怎会是10.50000??
那我在part指令的時候要怎樣下指令??
5楼2010-07-09 13:20:05
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triiawypm

银虫 (正式写手)

staphlee(金币+3): 2010-07-09 16:29:13
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-09 20:04:33
引用回帖:
Originally posted by staphlee at 2010-07-09 13:20:05:
請問一下
C24 1 0.68620 0.41890 0.48970 11.00000 0.05000
O3 6 0.50000 0.50000 0.50000 10.50000 0.05000
        请问这里C24怎会是11.00000而O3怎会是10.50000??
那我在part指令的時候要怎樣下指 ...

我也不清楚, 应该是O3在特殊位置, 所以是.5而不是1.
试一下:
part 1
C24 1  _ _ _ 21.0 0.05
O3 6 _ _ _  20.5 0.05
part 2
C24' 1 _ _ _ -21.0 0.05
O3' 6 _ _ _  -20.5 0.05
part 0

[ Last edited by triiawypm on 2010-7-9 at 16:26 ]
6楼2010-07-09 16:24:40
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staphlee

金虫 (正式写手)

有人可以帮帮我吗??
给我一下详细指令怎精修....拜托拜托
7楼2010-07-09 16:24:48
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staphlee

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by staphlee at 2010-07-09 13:20:05:


請問一下
C24 1 0.68620 0.41890 0.48970 11.00000 0.05000
O3 6 0.50000 0.50000 0.50000 10.50000 0.05000
        请问这里C24怎会是11.00000而O3怎会是10.50000??
那我在part指令的時候要怎樣下指 ...

我试过这些指令了
但是不管用
精修时显示不稳定
8楼2010-07-09 16:27:20
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staphlee

金虫 (正式写手)

有人可以幫幫我嗎??
9楼2010-07-10 11:03:44
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

请教LZ,三个原子成一条直线,该是什么分子呢?难道你要把它指认为二甲醚不成?我也遇到过这种现象,到现在还不知它是谁呢。还望LZ多多指教,谢谢!
10楼2010-07-10 11:28:01
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