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【原创】MS的过渡态搜索方法不合理！已有12人参与
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MS的的DMol和CASTEP模块中提供的LST/QST搜索过渡态的方法不合理！ 其利用RMS的收敛标准不能保证每个原子上的力都收敛，也就是无法满足鞍点的要求。 因此用LST/QST方法找过渡态一定要小心，通常得到的能垒是高估的。 在DMol中最好用Eigenvector following找过渡态！！！ 欢迎讨论！ |
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lywiailyw
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fzx2008: 金币+3, 谢谢指教！ 2012-11-20 20:54:18
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fzx2008: 金币+3, 谢谢指教！ 2012-11-20 20:54:18
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不敢同意。LST/QST计算完了之后为什么还要生成Hessian矩阵并再进行ts optimization呢？就是为了看看生成的过渡态是否确实只有一个大虚频的。RMS对于势能面的一阶鞍点与局域最小点都是有效的判断方式。 EF方法的最大问题在于EF法是只基于反应物结构搜索过渡态的算法，因此需要对过渡态有一个合理的初猜，否则难以判断哪个振动模式对应反应路径。另外，即使你不对过渡态结构有任何初猜而放任其彻底从头寻找，那么反应物结构生成Hessian矩阵后，一样很难判断究竟哪一个频率对应反应路径。虽然理论上一般认为反应路径在势能面比较平缓的区域，因此最小的那个频率对应反应路径，但现实计算中早已发现大部分情况都不是这样。选取最小的频率进行优化往往得不到任何结果。 |
18楼2012-11-20 19:42:55
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lvjian8596(金币+3):感谢交流！ 2010-07-07 22:25:48
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lvjian8596(金币+3):感谢交流！ 2010-07-07 22:25:48
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DMol中找过渡态要 先用TS Search - searches for a transition state using linear synchronous transit (LST) and quadratic synchronous transit (QST) methods 再进行 TS Optimization - searches for a transition state using eigenvector-following methods 最后再 TS Confirmation - produces a refined reaction path based on an LST or QST search |
2楼2010-07-07 22:09:22
cmwangdft
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请问您说的 TS Optimization - searches for a transition state using eigenvector-following methods 具体是怎么操作的啊？我先是TS Search（同时计算频率）找到了一个过渡态，然后该怎么操作呢？ 提示：In order to perform a TS Optimization caculation, a Hessian matrix must be present in the model.A Hessian matrix can be generated by running a frequency calculation on the model.Alternatively, a valid Hessian matrix can be imported.Once a Hessian is present, a normal mode should then be selected. 其中所提到的model是指哪个呢？ |
4楼2010-07-08 09:55:38