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【原创】MS的过渡态搜索方法不合理！已有12人参与
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MS的的DMol和CASTEP模块中提供的LST/QST搜索过渡态的方法不合理！ 其利用RMS的收敛标准不能保证每个原子上的力都收敛，也就是无法满足鞍点的要求。 因此用LST/QST方法找过渡态一定要小心，通常得到的能垒是高估的。 在DMol中最好用Eigenvector following找过渡态！！！ 欢迎讨论！ |
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lywiailyw
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fzx2008: 金币+3, 谢谢指教！ 2012-11-20 20:54:08
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ts optimization一般选择生成hessian矩阵之后的最小正频率，而不是选择虚频。所以正常情况下是不会把所有虚频消除的。只有在过渡态计算发现有不止一个虚频时才需要选择负频率进行ts optimization。 对于含多个原子的表面等复杂结构，superimpose structures本来就没办法勾选，但是照样可以对ts search的结果进行ts confirmation，你说的不太对。 ts optimization和ts confirmation都是关联于ts search的独立过程，所以ts confirmation不能，也没必要在ts optimization之后算，这一点你说的是对的。 |
17楼2012-11-20 19:30:28
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lvjian8596(金币+3):感谢交流！ 2010-07-07 22:25:48
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DMol中找过渡态要 先用TS Search - searches for a transition state using linear synchronous transit (LST) and quadratic synchronous transit (QST) methods 再进行 TS Optimization - searches for a transition state using eigenvector-following methods 最后再 TS Confirmation - produces a refined reaction path based on an LST or QST search |
2楼2010-07-07 22:09:22
cmwangdft
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请问您说的 TS Optimization - searches for a transition state using eigenvector-following methods 具体是怎么操作的啊？我先是TS Search（同时计算频率）找到了一个过渡态，然后该怎么操作呢？ 提示：In order to perform a TS Optimization caculation, a Hessian matrix must be present in the model.A Hessian matrix can be generated by running a frequency calculation on the model.Alternatively, a valid Hessian matrix can be imported.Once a Hessian is present, a normal mode should then be selected. 其中所提到的model是指哪个呢？ |
4楼2010-07-08 09:55:38