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一步一步

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】CoMFA或CoMSIA对化合物活性预测哪种方法好? 已有3人参与

在得到CoMFA或CoMSIA模型后,要用该模型对化合物进行活性预测。
我一般用两种方法:
1、AutoFill----predict
2、读出小分子后,然后再用spreadsheet中的QSAR----predict property

我一般是直接用第一种方法对训练集中的小分子活性进行预测,用第二种方法对测试集的生物活性进行预测,因为我不知道该怎么用第一种方法对测试集中的小分子进行活性预测。但是我发现对于训练集中的同一种化合物用第一种方法预测的活性值要比第二种方法预测的活性值更接近实验得到的活性值,第二种方法得到的活性预测值与实验得到的活性值相差很大。

我的问题:
1、为什么会出现这种情况啊?这两种方法哪种更好啊或更为准确啊?
2、对于测试集中的化合物能否用第一种方法预测活性值?如果能的话,拜托大家教教我,万分感谢!!
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

一步一步(金币+2): 2010-07-05 08:17:57
只有一个建议,仔细读 CoMFA 的文档,sybyl 的文档写得很详细了……
2楼2010-07-04 11:31:05
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一步一步

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2010-07-04 11:31:05:
只有一个建议,仔细读 CoMFA 的文档,sybyl 的文档写得很详细了……

好的,谢谢!!
3楼2010-07-05 08:18:26
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-07-05 10:05:34
一步一步(金币+1): 2010-07-05 13:11:17
你的操作还是有些问题,先按照手册上的例子走一遍,仔细体会一下范例。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2010-07-05 09:57:42
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