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wdongdong

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】蛋白结构 已有6人参与

我最近拿到一些新的蛋白,想知道其详细的结构和domain,不知道有什么好的网站能够通过序列进行预测,我用了SMART但是感觉不是很详细,请赐教,谢谢。
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月月大可

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-07-02 18:58:03
说句实话吧,你想知道详细的的结构除了获得三维结构没有其他手段。分子较小可以使用NMR,大于30KD就不行了。
目前最流行的方法就是蛋白结晶,使用X-ray衍射,解析三维结构。

做之前最好确认一下你的蛋白,新必须是功能上的独到才值得去结晶解结构。仅仅是物种或者序列上的新不一定有意义,也许PDB中一比对同源蛋白一箩筐。那样功能直接看同源蛋白就基本上清楚了。
6楼2010-07-02 18:56:47
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看天

木虫 (知名作家)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wdongdong at 2010-07-02 13:38:24:
我最近拿到一些新的蛋白,想知道其详细的结构和domain,不知道有什么好的网站能够通过序列进行预测,我用了SMART但是感觉不是很详细,请赐教,谢谢。

不清楚  定
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
2楼2010-07-02 14:25:47
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免贵姓刘

新虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):鼓励新虫交流。 2010-07-02 16:45:18
应该可以用圆二色光谱测定吧
3楼2010-07-02 16:38:48
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lvtd

金虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
现在分析用的比较多的就是smart,不知道你想要什么。所以也没法说啊。
tobeornottobe,thisisaquestion!
4楼2010-07-02 17:02:43
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