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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】蛋白结构
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wdongdong

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】蛋白结构 已有6人参与

我最近拿到一些新的蛋白，想知道其详细的结构和domain,不知道有什么好的网站能够通过序列进行预测，我用了SMART但是感觉不是很详细，请赐教，谢谢。
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1楼 2010-07-02 13:38:24
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看天

木虫 (知名作家)
★
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引用回帖:
Originally posted by wdongdong at 2010-07-02 13:38:24:
我最近拿到一些新的蛋白，想知道其详细的结构和domain,不知道有什么好的网站能够通过序列进行预测，我用了SMART但是感觉不是很详细，请赐教，谢谢。

不清楚  定
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戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
2楼2010-07-02 14:25:47
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免贵姓刘

新虫 (初入文坛)
★ ★
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dhd997(金币+1):鼓励新虫交流。 2010-07-02 16:45:18
应该可以用圆二色光谱测定吧
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3楼2010-07-02 16:38:48
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lvtd

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
现在分析用的比较多的就是smart，不知道你想要什么。所以也没法说啊。
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tobeornottobe,thisisaquestion!
4楼2010-07-02 17:02:43
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zemin_fang

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
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amisking(金币+2):欢迎交流，最近很活跃啊！ 2010-07-02 18:24:50
在expasy中找吧，总有一款适合你
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5楼2010-07-02 17:58:52
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月月大可

木虫 (著名写手)
★ ★
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dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-07-02 18:58:03
说句实话吧，你想知道详细的的结构除了获得三维结构没有其他手段。分子较小可以使用NMR，大于30KD就不行了。
目前最流行的方法就是蛋白结晶，使用X-ray衍射，解析三维结构。

做之前最好确认一下你的蛋白，新必须是功能上的独到才值得去结晶解结构。仅仅是物种或者序列上的新不一定有意义，也许PDB中一比对同源蛋白一箩筐。那样功能直接看同源蛋白就基本上清楚了。
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6楼2010-07-02 18:56:47
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
如果要做到三维结构就是大工程了，结晶是个难题
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
7楼2010-07-02 19:55:33
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