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greenking

木虫 (正式写手)

I'm goddy !

[交流] 【请教】如何继续往下解 【已搜无重复】 已有6人参与

我运行SHELXTL程序的时候,第一步XPREP,得到ins文件,可里面的内容只有如下的几行:
TITL abc-0m in P-1   
CELL 0.71073   9.8980  11.2893  25.8933  93.307  90.630 108.330
ZERR   16.00   0.0004   0.0004   0.0009   0.002   0.002   0.002
LATT  1
SFAC C H N O P V CU MO
UNIT 16 16 16 16 16 16 16 16
TEMP 0
TREF
HKLF 4
END
手输分子式的时候,我只输入了原子种类,没写原子个数。它就默认为是“UNIT 16 16 16 16 16 16 16 16”,全是16,不知这样对后面影不影响??

第二步,用XS建立初始套时,运行完得到一个res文件,在进行第三步XL精修的时候,却总是出现如下对话框:



请问我该怎样继续往下解呢??

[ Last edited by greenking on 2010-7-1 at 09:54 ]
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让心儿自在飞翔
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
帝夫(金币+3):谢谢回帖交流 2010-07-01 10:41:35
greenking(金币+2):谢谢!请问在XSHELL里面与在XP中看图与指认,有什么区别吗? 2010-07-01 20:39:59
Xprep 生成的INS文件里面只是给出一个直接法去解你的结构,你xs以后可以点击XSHELL,然后看到几个指定好的原子,和一些q峰。你将一些q指认为一些原子,比如碳啊氧啊什么的,然后删除多余的q峰,在refine,就可以了。这样重复,如果晶体好,空间群选的对,就会解出来的
学无止境
3楼2010-07-01 10:25:58
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
帝夫(金币+3):感谢回帖交流! 2010-07-01 23:13:12
引用回帖:
Originally posted by greenking at 2010-07-01 11:20:05:

请问在XSHELL里面与在XP中看图与指认,有什么区别吗?
我在这一步没能确定给定原子和Q峰,对后面的XL有影响吗?

我解晶体的时候大多时候是用XSHELL的,因为我觉得方便一些,xp 里面你还要退出视图,然后输入命令,命名或者精修都不方便。XSHELL里面可以直接显示椭球结构,你可以拖动鼠标转动你的分子,命名的时候把鼠标放到一个原子或者Q峰上,然后按“S"键意思是select,就选中了,你可以选很多,然后点击labels,grouplabel...选择原子类型,然后OK。不想要的q峰,把鼠标放上去点击”k“ 意思是kill。命名完以后,删除所有q峰,点击refine,最好每次refine都选中anise~
就这样重复精修,就会解出来了。

不知道为什么上传不了图片~~希望对你有帮助
学无止境
14楼2010-07-01 23:08:39
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
yanhualover(金币+2):谢谢交流 2010-07-03 04:23:22
引用回帖:
Originally posted by triiawypm at 2010-07-03 00:12:24:


对,XSHELL定原子的时候很方便。
不过似乎这里面有的时候加氢会问题,以前我在给eta5配位的茂环加氢的时候就不行,可能是我没有开发出来真正的用法。所以加氢的时候我都是去XP里面输命令。有的时候感 ...

恩,其实我加氢也是用xp的,因为xshell有时候会加错,不过可以到INS文件里面改。对于eta5配位的茂环加氢,你要先选择碳原子的杂化类型才能加对。我只是觉得xshell操作起来方便,对于刚入门的人,不用记那么多命令,学的快~
学无止境
16楼2010-07-03 01:29:50
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-03 16:39:33
引用回帖:
Originally posted by triiawypm at 2010-07-03 01:40:51:


非配位的基茂环上面,如果没有氢的话,每个C上就是两个键了。
而配位的,则每个茂环上的C都与金属之间又有了一个键,所以如果把茂环的C设成SP2的话,那么三个键已经满了。如果设成SP3的话,那么加氢 ...

呵呵,没遇到过这种情况,我们一般只有苯环~
学无止境
18楼2010-07-03 01:52:23
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