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zwhgb

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求使用MS中sorption模块用于分子筛吸附小分子的问题 已有3人参与

拟用sorption做分子筛(多孔材料)孔道中的模板剂(小分子)的定位情况,文献中有讲是用的monte carb方法

我估计也就是用sorption模块来模拟下 在固定吸附量的情况下的吸附情况。然后我就做了2*2*1的晶胞吸附 比如甲苯这样的有机小分子,也运行成功了,得到的并不是我想要的小分子在孔道中的排布情况,而是一些能量块,红色的点点的形式。请问大家这是什么情况?

是不是sorption模块就这样?

文献中有提到用monte carlo方法还有用Insight 2生物分子模拟软件来做的,能否能得到我的预期?

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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

★ ★ ★ ★
zwhgb(金币+1):谢谢参与
zwhgb(金币+10): 2010-06-28 18:40:58
lei0736(金币+3):谢谢 2010-06-29 20:53:43
这种图可以用MS获得,你在计算Sorption的时候,对于任务有个more,点击开来,里面有个low energy frame之类的复选框,勾上,这样算完就可以看到你想看到的snapshot了。
2楼2010-06-28 11:44:40
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