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gsf313

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】分步酶切 回收 求助 已有13人参与

我切一个载体,Ecor I 和 Xho I,宝生物的酶,这两个酶的buffer都是1xk

因为两个酶切位点之间只差6个碱基,所以同时双酶切老是切不开。分步酶切的话,第一次用Ecor I切完,用胶回收试剂盒回收片段,再 Xho I切。第二次回收,总是收不回来片段。

我现在想用30/50ul 体系,先 1ul Ecor I ,3ul 10XK buffer,10ul 质粒,补水到30ul,切三个小时,不回收,直接再加2ul 10XK buffer,1.5ul Xho I,加水补到50ul,再切三小时,大家看可行么?给点建议啊,我快急疯了,眼看就毕不了业了……

补充一些疑问点:1。第一次酶切后,需不需要加热使酶失活,然后再进行下一步?如果需要,怎么加热?多少度?加热多久?

2。加第二个酶的时候,10XK buffer 加5ul 还是3ul? 因为两个酶的buffer一样,所以有此疑问
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zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)

以前我也遇到过这样的问题,第一个酶切后过柱子回收损失太多,可以采用乙醇沉淀的方法进行回收。建议先用其中一个酶进行酶切,结束后乙醇沉淀DNA,然后进行第二个酶切,然后胶回收、连接、转化。

附:乙醇沉淀protocol(具体原理可参照分子克隆)

加入0.1倍体积的乙酸钠(3M,pH5.2),然后加入2倍体积的乙醇,混匀后置4℃作用30min,12000rpm离心10min,倒掉上清,余下的沉淀即为DNA,可能肉眼不可见。开盖放置一段时间,让乙醇充分挥发,以免影响后续试验。
我有一个梦想,我梦想有一天,我们的人民可以根据自己的意愿与消费能力,居住在自己愿意居住的地方。
16楼2010-07-01 16:27:21
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xiangyunch

金虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
一般情况下65度十分钟就可以使酶失活
2楼2010-06-26 08:43:41
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珊瑚木子

铜虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看天(金币+1):谢谢交流 2010-06-26 11:13:49
我觉得酶是应该灭一下的,好像在酶试剂说明书上见过有终止反应的试剂,你可以再去看看。
第二次这样加buffer 好像不是可以完全确定到底加多少吧?
或许你可以换一下切得顺序。
不是太懂,接供参考。
3楼2010-06-26 08:50:11
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gsf313

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 珊瑚木子 at 2010-06-26 01:50:11:
我觉得酶是应该灭一下的,好像在酶试剂说明书上见过有终止反应的试剂,你可以再去看看。
第二次这样加buffer 好像不是可以完全确定到底加多少吧?
或许你可以换一下切得顺序。
不是太懂,接供参考。

说明书上写了,我们跑胶用的loading buffer就含反应终止成分,但是不知道该怎么加量,加完以后是否需要纯化,这个,有高人知道么?
4楼2010-06-26 09:16:47
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