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heihei3910

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请高人帮我详尽的分析一段DNA序列 已有12人参与

请高人帮我详尽的分析一段DNA序列。
我的这段DNA序列是利用兼并引物从一个放线菌的基因组DNA中扩增出来的。
希望高人能非常详尽的分析一下这段序列与哪个基因同源性最高?保守序列在哪里?有保守结构域吗?同时能够与最同源的一些做个聚类分析。总之是越详细越好。

灌水的不要啊!!!

ATTCCACTGGGCGCCATGGCCGGAAAACTTCACCGAGTCGTAGTTGGTGCCGAAGGCCCCCGCGTCGACCAGTTCCCTGATCTTGCCCAACGCCTTGCGGCTGTCCGGGCTCGCCCAGACCTCCCGGTCGCCCGCGAGCGCCTTCTCGAAGAGTTCCGGGCCGGCGATGCGGTCGTAGAGGTACTCGAACCACATCAGTGTCGGCCACCGGTCGCCGCCGCCCAGCGCGATCGGGGTGACGCCGTCCGACTTCAGCGCTTTGACCGCCGCGAGCAGGTCGTCCCAGGTCTCGGGCGGTTCGACGCCCGCCTTCTTCAGGACCTTGCCGTTGTGGGAGAGCAGCACGGGCTGCGTCCCGCGCATGGGGACCCCGTAGGAGGCGCCGTCGACCACCGCGCTGTTGAAGACGGACGGCAGGAACTTCTCCTTGAGGGCGGGGTCCTCCTCGATGAACGGGTCCAGCGGGAGCAACAGGTCGGCGTCGACGAACGGCTTGATGCTGCCGCCGCCCCAGTTGAAGAAGACGTCGGACGCCTGCTTGCTGTTGATGATCGTCTGGAGTTTGGCCTGGTAGTCGGCGCCCGGGATGGTGTCCAGGACGGCCTTCACCTTCGACGTCTTGTTGAAGGTGGCGACGATCTCCTTCTCCACCTTGTTCGCCGCGTCCCCGTCCCGTGCGCCTCAAT
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by heihei3910 at 2010-06-30 11:24:29:
受不了了啊

希望高人能非常详尽的分析一下这段序列与哪个基因同源性最高?
同源性最高的基因序列通过NCBI完全能够比对出来,你自己都说会,那就自己比对一下就可以了啊.

保守序列在哪里?有保守结构域吗?
同源性高的基因序列有了,你将其下载下来用比对软件以比对,能够比对上的区域不就是保守的序列了吗?

同时能够与最同源的一些做个聚类分析。
序列你都有了,聚类分析用软件就可以自己聚类了啊。

总之是越详细越好。
16楼2010-06-30 15:03:43
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tianlus1632

木虫 (正式写手)

直接用ncbi里的blast分析就可以拉
2楼2010-06-24 20:31:19
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yuyixst

木虫 (正式写手)

这个不用高手就可以
3楼2010-06-24 20:37:47
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ben1147

木虫 (正式写手)


lstt09nk(金币+1):呵呵,感觉像丢东西似的~~ 2010-06-29 19:05:47
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome

序列丢进去,database选others,点最下边的BLAST,等结果吧
4楼2010-06-24 20:42:19
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