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byin

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】MS在Linux下的并行计算问题 已有5人参与

先在win下生成计算castep所需的文件，param和cell，导入Linux系统。


在计算的时候，如果不指定cpu的个数，直接“./RunCastep.sh name”，就能计算。
生成的std_out.txt显示：
Checked out license feature: MS_castep [for Unavailable] (1 copy)


但是如果指定个数，例如，“./RunCastep.sh -np 4 name”，就会出错，算不了。
生成的std_out.txt显示：
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
invalid "local" arg: -e

usage:
mpiexec [-h or -help or --help]    # get this message
mpiexec -file filename             # (or -f) filename contains XML job description
mpiexec [global args] [local args] executable [args]
   where global args may be
      -l                           # line labels by MPI rank
      -bnr                         # MPICH1 compatibility mode
      -machinefile                 # file mapping procs to machines
      -s                     # direct stdin to "all" or 1,2 or 2-4,6
      -1                           # override default of trying 1st proc locally
      -ifhn                        # network interface to use locally
      -tv                          # run procs under totalview (must be installed)
      -tvsu                        # totalview startup only
      -gdb                         # run procs under gdb
      -m                           # merge output lines (default with gdb)
      -a                           # means assign this alias to the job
      -ecfn                        # output_xml_exit_codes_filename
      -recvtimeout    # timeout for recvs to fail (e.g. from mpd daemon)
      -g           # global version of local arg (below)
    and local args may be
      -n or -np             # number of processes to start
      -wdir               # working directory to start in
      -umask                # umask for remote process
      -path               # place to look for executables
      -host              # host to start on
      -soft                  # modifier of -n value
      -arch                  # arch type to start on (not implemented)
      -envall                      # pass all env vars in current environment
      -envnone                     # pass no env vars
      -envlist # pass current values of these vars
      -env           # pass this value of this env var
mpiexec [global args] [local args] executable args : [local args] executable...
mpiexec -gdba jobid                # gdb-attach to existing jobid
mpiexec -configfile filename       # filename contains cmd line segs as lines
  (See User Guide for more details)

Examples:
   mpiexec -l -n 10 cpi 100
   mpiexec -genv QPL_LICENSE 4705 -n 3 a.out

   mpiexec -n 1 -host foo master : -n 4 -host mysmp slave
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

不知道有没有朋友遇到过这种情况，多多帮忙。服务器不能并行等于没用啊~~


PS：还有不管指不指定，都会出现如下的一段提示：
/home/ybl/Accelrys/MaterialsStudio50/share/bin/runMSserver.sh: eval: line 3: syntax error near unexpected token `('
/home/ybl/Accelrys/MaterialsStudio50/share/bin/runMSserver.sh: eval: line 3: `LD_LIBRARY_PATH=/home/ybl/Accelrys/MaterialsStudio50//lib:/home/ybl/Accelrys/MaterialsStudio50//lib/32:/opt/intel/cce/10.1.018/lib:/opt/intel/fce/10.1.018/lib; export LD_LIBRARY_PATH; OMP_NUM_THREADS=1; export OMP_NUM_THREADS; F_UFMTENDIAN=big; export F_UFMTENDIAN; MPI_VER=mpiexec_saammsg.zju.edu: cannot connect to local mpd (/tmp/mpd2.console_ybl); possible causes:; export MPIVER; MPI_ROOT=/usr/local; export MPI_ROOT; MPI_COMMAND="/usr/local/bin/mpirun -e MPI_REMSH=/usr/bin/ssh -prot -f APPFILE "; export MPI_COMMAND; GATEWAY_TMP="/home/ybl/tmp"; export GATEWAY_TMP; ulimit -Ss unlimited;'


望高手指点，不胜感激！
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1楼 2010-06-24 14:06:06
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njuswj

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-05-29 23:24:33
请问你的hpmpi是不是用root用户默认安装的?
如果不是, 你需要修改hpmpi的路径, 如果是, 我就不知道是怎么回事了...
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-05-29 12:27:56
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查看全部 6 个回答

jghe

金虫 (著名写手)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-06-25 07:39:44
可能是你的mpi没有装好
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-06-24 20:50:39
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wydzyx2003

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-05-29 12:51:10
你不指定多核计算，只用一核试试。如果可以就是HPMPI没装好，我也正发愁呢。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-05-29 12:01:24
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flywander

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
同样的问题，求高手解答。。。。
赞一下 回复此楼
5楼2012-10-24 23:35:57
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