应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】structure-based alignment
81/1返回列表
查看: 1321  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pitty595

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】structure-based alignment 已有5人参与


如图，要做出这样的氨基酸多序列比对，并标有二级结构信息，需要用什么工具呢？怎么做？有谁知道吗？谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-06-20 21:11:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaohw

新虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-06-21 12:30:14
上这个网站，http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-06-21 12:25:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pitty595

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yaohw at 2010-06-21 12:25:24:
上这个网站，http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/

谢谢你哦，不错的网站。
但是好像用不了啊，要注册，需要邮寄，好复杂啊？你用过吗？可否介绍下。

[ Last edited by pitty595 on 2010-6-21 at 21:03 ]
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-21 20:43:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaohw

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
可以在线用的，网站上的说明其实挺清楚的。当然也可以直接下载，不用注册和邮寄。在线用是这样的，点击黄色字体Execute，上传相应格式的序列比对文件，上传需要的结构文件，输出格式根据自己需要是可以调的。这是最基本的用法，可以满足大多情况，还有更多的功能，根据自己需要去看DOC，里面有manual，tutorial等。希望对你有用。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-06-22 12:56:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pitty595

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yaohw at 2010-06-22 12:56:58:
可以在线用的，网站上的说明其实挺清楚的。当然也可以直接下载，不用注册和邮寄。在线用是这样的，点击黄色字体Execute，上传相应格式的序列比对文件，上传需要的结构文件，输出格式根据自己需要是可以调的。这是 ...

不错！就是一定要知道结构了？如果没有相关的结构报道的话，就不可以用了？
赞一下 回复此楼
5楼2010-06-23 14:22:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zemin_fang

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
expasy，里面的很多软件都可以，你自己选吧。
http://www.expasy.ch/
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-06-23 15:14:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaoen

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个软件做出来的图片很漂亮，但是怎么把二级结构放在其中。我选择了要分析的PDB和chainA，但是每次都是出错，有没有用过这个软件朋友？多谢！
赞一下 回复此楼
7楼2013-07-13 03:57:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

乐乐3952

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by chaoen at 2013-07-13 03:57:39
这个软件做出来的图片很漂亮，但是怎么把二级结构放在其中。我选择了要分析的PDB和chainA，但是每次都是出错，有没有用过这个软件朋友？多谢！

现在在用，一直也是出错……不知你是否解决？
赞一下 回复此楼
一花一世界、一叶一菩提
8楼2014-08-22 16:42:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pitty595 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-30 10:33 by winsaint
[考博] 找导师 +4 yuanjiabao 2026-08-29 5/250 2026-08-30 09:52 by onesupeng
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 06:57 by ZPa0EcMwuECS
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 06:35 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 06:00 by ZPa0EcMwuECS
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 05:48 by ZPa0EcMwuECS
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 13/650 2026-08-30 05:38 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 02:09 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:58 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:25 by ZPa0EcMwuECS
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 01:14 by ZPa0EcMwuECS
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 01:12 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭