应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】structure-based alignment
81/1返回列表
查看: 1098  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pitty595

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】structure-based alignment 已有5人参与


如图，要做出这样的氨基酸多序列比对，并标有二级结构信息，需要用什么工具呢？怎么做？有谁知道吗？谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-06-20 21:11:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaohw

新虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-06-21 12:30:14
上这个网站，http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-06-21 12:25:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pitty595

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yaohw at 2010-06-21 12:25:24:
上这个网站，http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/

谢谢你哦，不错的网站。
但是好像用不了啊，要注册，需要邮寄，好复杂啊？你用过吗？可否介绍下。

[ Last edited by pitty595 on 2010-6-21 at 21:03 ]
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-21 20:43:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaohw

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
可以在线用的，网站上的说明其实挺清楚的。当然也可以直接下载，不用注册和邮寄。在线用是这样的，点击黄色字体Execute，上传相应格式的序列比对文件，上传需要的结构文件，输出格式根据自己需要是可以调的。这是最基本的用法，可以满足大多情况，还有更多的功能，根据自己需要去看DOC，里面有manual，tutorial等。希望对你有用。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-06-22 12:56:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pitty595

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yaohw at 2010-06-22 12:56:58:
可以在线用的，网站上的说明其实挺清楚的。当然也可以直接下载，不用注册和邮寄。在线用是这样的，点击黄色字体Execute，上传相应格式的序列比对文件，上传需要的结构文件，输出格式根据自己需要是可以调的。这是 ...

不错！就是一定要知道结构了？如果没有相关的结构报道的话，就不可以用了？
赞一下 回复此楼
5楼2010-06-23 14:22:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zemin_fang

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
expasy，里面的很多软件都可以，你自己选吧。
http://www.expasy.ch/
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-06-23 15:14:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaoen

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个软件做出来的图片很漂亮，但是怎么把二级结构放在其中。我选择了要分析的PDB和chainA，但是每次都是出错，有没有用过这个软件朋友？多谢！
赞一下 回复此楼
7楼2013-07-13 03:57:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

乐乐3952

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by chaoen at 2013-07-13 03:57:39
这个软件做出来的图片很漂亮，但是怎么把二级结构放在其中。我选择了要分析的PDB和chainA，但是每次都是出错，有没有用过这个软件朋友？多谢！

现在在用，一直也是出错……不知你是否解决？
赞一下 回复此楼
一花一世界、一叶一菩提
8楼2014-08-22 16:42:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pitty595 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] A区线材料学调剂 +3 周周无极 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:48 by zhukairuo
[考研] 0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历 +13 曦熙兮 2026-03-15 13/650 2026-03-20 19:35 by Dream007008
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 289求调剂 +3 怀瑾握瑜l 2026-03-20 3/150 2026-03-20 16:17 by Iveryant
[考研] 085600材料与化工 +6 安全上岸！ 2026-03-16 6/300 2026-03-20 15:07 by lbsjt
[考研] 295材料求调剂，一志愿武汉理工085601专硕 +4 Charlieyq 2026-03-19 4/200 2026-03-20 14:26 by 无懈可击111
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 3/150 2026-03-20 11:58 by 呱呱呱呱叫
[考研] 329求调剂 +6 想上学吖吖 2026-03-19 6/300 2026-03-20 09:00 by 每天只摆一小会
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +3 llllkkkhh 2026-03-18 3/150 2026-03-19 14:22 by houyaoxu
[考研] 346求调剂[0856] +3 WayneLim327 2026-03-16 6/300 2026-03-19 11:21 by WayneLim327
[考研] 304求调剂 +6 司空. 2026-03-18 6/300 2026-03-18 23:03 by 星空星月
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-17 7/350 2026-03-18 20:41 by Wangjingyue
[考研] 297求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-17 8/400 2026-03-18 14:30 by laoshidan
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林，给自己招师弟中～ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[基金申请] 今年的国基金是打分制吗？ 50+3 zhanghaozhu 2026-03-14 3/150 2026-03-16 17:07 by 北京莱茵润色
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭