| 查看: 617 | 回复: 3 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】正确的初始结构是如何建立的？已有3人参与
|
|||
|
我始终对正确的初始结构的建立没有搞明白。以我计算键能的葡萄糖为例，我是经过这样几个步骤： 1。在课本上看到葡萄糖的结构，其中重要的结构特征是直立健和平伏健的差别 2。用chemdraw将上述结构画出来，其中直立键和平伏键就是通过目测，感觉相对环平面是直立或平伏就行了。（这样做行吗？） 3。转送结构至chem3D 4。用chem3D创建输入文件，用gaussian计算。 大家可以看出这个过程，只有通过目测保证键的直立或平伏，这样是不是太不保险了？ |
回复此楼» 猜你喜欢
超导转变温度NaN
已经有4人回复
-
华南师范大学先进光电子研究院电子纸团队诚聘2026级博士研究生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有295人回复
-
QE利用声子计算的一系列lambda和Tc如何选
已经有8人回复
-
理论计算合作
已经有2人回复
-
小木虫的论文辅导靠谱吗？有没有用过的同学？
已经有1人回复
-
QE计算声子ph.out的Γ点出现虚频（-30cm-1）vasp计算没有
已经有0人回复
-
40-50万/年，中国散裂中子源诚聘计算模拟方向博士后
已经有81人回复
-
书籍求助：汽车市场营销理论与实务（电子版）——章小平
已经有0人回复
-
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
关于vasp收敛和优化
已经有24人回复- 【求助】如何利用分子动力学加速DFT计算的收敛
已经有6人回复
- 【求助成功】如何用VASP计算反铁磁
已经有14人回复
- 【求助】50金币求助，金属间界面和金属氧化物间界面模型怎么建立？
已经有30人回复
yyx19840628
木虫 (著名写手)
鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
- 应助: 4 (幼儿园)
- 贵宾: 0.41
- 金币: 3522.9
- 散金: 50
- 红花: 8
- 帖子: 2320
- 在线: 128.9小时
- 虫号: 508615
- 注册: 2008-02-21
- 性别: MM
- 专业: 环境污染化学
4楼2010-06-17 16:58:16
2楼2010-06-16 10:18:30
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！！ 2010-06-16 17:44:58
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！！ 2010-06-16 17:44:58
|
对于有机化合物而言，通过化学绘图软件得到的平面结构式就包含了键长、键角的基本准确的信息，所以，其初始结构就算确定了。原因是，有机化学涉及到的是共价键，其键长、键角在软件内部有一个预设数值，软件可以对绘制图形做初步优化。 另外，量子化学计算中需要输入的只是原子的坐标，这就决定了键长和键角。但是，我们并不明白软件哎几何结构优化时是如何处理这些坐标的-SCF是如何变动这些坐标，在什么范围内变动这些坐标。 这就是我们没有源代码或者不去了解源代码的后果。 |
3楼2010-06-16 17:32:55