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triiawypm

银虫 (正式写手)

[交流] 【请教】解析晶体过程中一些指令的使用 已有4人参与

1. SAME指令是什么功能, 如何使用?
说什么1,2- 1,3-距离,是什么意思?

2. 权重因子后面有的时候是两个数,有的时候是一个数,这些数分别代表的是什么?

[ Last edited by triiawypm on 2010-6-25 at 09:33 ]
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lisj04001

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
triiawypm(金币+2):谢谢, 希望继续关注此帖. 2010-06-09 21:02:11
wsht212(金币+2):谢谢交流,希望常来! 2010-06-09 23:03:17
exptl_absorpt_correction_T_min   ?
     _exptl_absorpt_correction_T_max
在你check的报告里就有。

measurement_theta_min       ?
_cell_measurement_theta_max       ?
在cif文件的下面有  :_diffrn_reflns_theta_min          2.50
_diffrn_reflns_theta_max          24.91
填到上面就好了

z值直接在cif里改
2楼2010-06-09 20:06:47
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triiawypm

银虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lisj04001 at 2010-06-09 20:06:47:
exptl_absorpt_correction_T_min   ?
     _exptl_absorpt_correction_T_max
在你check的报告里就有。

measurement_theta_min       ?
_cell_measurement_theta_max       ?
在cif文件的下面有  :_diff ...

按Check报告里面的去填?那不是打哪儿指哪儿了吗?

对啊, CIF文件里面有diffrn_reflns_theta_min          2.50
_diffrn_reflns_theta_max          24.91
还要把这个填到上面去?一个CIF文件里面出现两次这两个数儿?

[ Last edited by triiawypm on 2010-6-9 at 20:37 ]
3楼2010-06-09 20:24:57
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bsnow

木虫 (小有名气)


triiawypm(金币+2):谢谢, 不过PCF也是空的. 2010-06-09 21:02:29
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-06-09 23:03:53
1:_exptl_absorpt_correction_T_min   ?
     _exptl_absorpt_correction_T_max
还有:_cell_measurement_theta_min       ?
_cell_measurement_theta_max       ? 这些值在PCF文件中找
2 Z值自己算,用单胞体积除以18或20然后再除以所有非氢原子的个数,一般为2,4,8,16,算好后在INS文件中修改Z值以及原子数,修一下就好了
4楼2010-06-09 20:27:10
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triiawypm

银虫 (正式写手)

帝夫:谢谢回帖交流~ 2010-06-12 17:35:58
引用回帖:
Originally posted by bsnow at 2010-06-09 20:27:10:
1:_exptl_absorpt_correction_T_min   ?
     _exptl_absorpt_correction_T_max
还有:_cell_measurement_theta_min       ?
_cell_measurement_theta_max       ? 这些值在PCF文件中找
2 Z值自己算,用单 ...

PCF文件里面是应该有这些数据,不过我的PCF文件里面也是待填的,
这些数据最初出在哪里啊?我少做了哪些工作造成这些数据没有填到PCF里面呢?
如果PCF里面有的话, 那需要手动写到CIF里面去吗?
5楼2010-06-09 20:40:21
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bsnow

木虫 (小有名气)

triiawypm(金币+1):我的PCF里面没有这些, 那就是做数据还原没做好的事情是吧?那就只有手动填了是吗? 2010-06-10 21:47:23
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-06-26 13:49:03
数据还原时生成的。这些数据不大重要,可以自己填写,
6楼2010-06-09 21:59:59
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lisj04001

铁杆木虫 (著名写手)

triiawypm(金币+1):两者是不一样的, 上面的是用于确定晶胞的衍射点的最大最小theta值 2010-06-10 21:46:41
triiawypm(金币+1):而这个应该是指总的范围. 就像确定晶胞用的衍射点只需要总衍点的一小部分(几十个)就行了. 2010-06-10 21:50:27
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-06-26 13:49:28
对啊, CIF文件里面有diffrn_reflns_theta_min          2.50
_diffrn_reflns_theta_max          24.91
还要把这个填到上面去?一个CIF文件里面出现两次这两个数儿?
就是这样的  出现两次
7楼2010-06-10 21:14:49
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triiawypm

银虫 (正式写手)

顶一下.
8楼2010-06-25 09:33:36
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-06-25 10:29:03
triiawypm(金币+2):哈哈,谢谢交流. 我这里没有机器生成的CIF文件. 咱们讨论现在帖子里面的话题吧,那个结题了.哈哈. 2010-06-25 10:36:36
本菜鸟这里凡是与机器有关的数据,都列在数据收集时机器生成的CIF文件里,而非晶体解析时生成 的CIF文件。所以解晶体生成的CIF文件里缺什么,就到机器生成 的CIF文件里找。并不是一个CIF文件里一个数据出现两次,此CIF非彼CIF也。
9楼2010-06-25 10:02:50
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


帝夫(金币+1):感谢回帖交流! 2010-06-26 09:35:35
triiawypm(金币+3):哈哈, 全是英文啊. 谢谢你啊. 2010-06-26 10:05:26
SAME
With the help of SAME, the geometry of two or more groups of atoms can be
restrained to be similar. This can be convenient when a structure contains several
crystallographically independent but geometrically equivalent molecules or ligands.
The SAME command generates the necessary SADI restraints with appropriate
standard uncertainties (0.02 Å for 1,2-distances and 0.04 Å for 1,3-distances) for
equivalent molecules or parts of molecules. It is a very powerful restraint but
particularly error-prone, since it requires both the atoms named with the restraint and
the atoms following the SAME command in the .ins file to be in the correct order.
10楼2010-06-26 09:34:52
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