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sand0811

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】真是急死个人啊,实验啊实验已有7人参与

卡在这边好几个月了,怎么也想不到是怎么回事……
微卫星引物筛选。用AFLP的方法双酶切连接(酶切连接同时进行),然后进行磁珠吸附等步骤,一个测序结果包括好多的接头序列,支离破碎啊……哪位好心的前辈来指点指点……
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张力民1598

铜虫 (小有名气)

没做过,学习一下
2楼2010-06-08 11:23:18
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雪山飞狐7233

铁杆木虫 (著名写手)

铁杆小虫

应该学习,实验无止境!
梦在路就在!
3楼2010-06-08 11:34:18
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ben1147

木虫 (正式写手)


1949stone(金币+1):感谢分享经验 2010-06-08 14:07:13
磁珠是streptavidin包被的么?接头生物素化过了?
出了问题,酶切和连接最好分开做了

最后切胶l了么?有没有切到杂带?
4楼2010-06-08 12:09:17
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sand0811

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by ben1147 at 2010-06-08 12:09:17:
磁珠是streptavidin包被的么?接头生物素化过了?
出了问题,酶切和连接最好分开做了

最后切胶l了么?有没有切到杂带?

磁珠和生物素都应该是没问题的……切胶回收的时候尽量切的片段都比较长,500bp以上到1000bp,关键是杂带的话也不应该是到处都有接头呀,这个事情很诡异~难道是酶切连接的时候切开自己又连上了?
5楼2010-06-08 14:25:47
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

我做了一个pcr一个月也是没有结果,郁闷,现在正在休息,祝福啊~
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
6楼2010-06-08 15:33:14
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林翘

木虫 (著名写手)

我不知你为什么要把酶切和连接放在一起做!我个人实验经验告诉我,连接时有杂质难连上。是不是你有什么新手段?请教了。
7楼2010-06-08 15:42:13
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ben1147

木虫 (正式写手)


scelab(金币+1):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-06-08 22:52:00
sand0811(金币+30):太谢谢了,如此耐心~ 2010-06-09 09:43:35
还是建议酶切连接分开做,体系对酶切影响不大,但是Ligase还是比较挑剔环境的。

而且测序结果倾向于说明连接体系有问题
8楼2010-06-08 17:15:11
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yinbo2002

银虫 (小有名气)

接头不对吧。
9楼2010-06-08 23:19:09
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sand0811

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by 林翘 at 2010-06-08 15:42:13:
我不知你为什么要把酶切和连接放在一起做!我个人实验经验告诉我,连接时有杂质难连上。是不是你有什么新手段?请教了。

是我们这里一个实验室做AFLP是这么做的~现在我有点怀疑这个方法不太靠谱了……
10楼2010-06-09 09:40:06
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