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sunhongjuan

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】序列比对中的问题 已有7人参与

我在对20种灰霉菌的ITS序列进行比对后,为什么开头部分和结尾部分有很多序列不能配对,请大家指教这是什么原因造成的?
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sunhongjuan

铁虫 (初入文坛)

那这样不就是忽略了他们之间的差异性吗
12楼2010-06-16 09:43:32
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gaiyf

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2):最近很活跃。 2010-06-06 21:01:49
那时侧序的问题,一般的测序在开始和最后几个碱基都是不是很准确的,不过这是不用担心的,不会影响到后面的检测
多看文献,多学知识
2楼2010-06-06 20:38:09
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sunhongjuan

铁虫 (初入文坛)

再次请教

谢谢楼上了。想再请教一下,这种结果有没有可能是种内的变异造成的
3楼2010-06-07 09:22:08
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

一般开始的部分序列肯定是不准确的,无法用来做研究的。但是如果你是将序列构建克隆后测序,那就很准确了。
4楼2010-06-07 14:41:47
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