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cenwanglai

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[交流] 【求助成功】NEB计算,每个POSCAR的设置和slab结构优化一样吗? 已有3人参与

要做NEB了,关心的是能垒.第一次.
看了http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/#NEB

还是想听听大家的建议.

体系: CeO2表面小分子的吸附迁移,50-60个原子左右.
机器: E5410四核两颗,8核8G内存.并行版vasp4.6 OS Rhel 5.2

(1)每个POSCAR(or image)的设置跟单个slab模型原子位置优化的设置一样吗?

...............................
selective dynamic
directive
xx  yy  zz    T  T  T
.................................
XX YY  ZZ   F   F   F

...............................

????

(2)vasp manual 2009 P84 末尾说
先在端点间插入一个image,收敛后增加image. 意思是用二分法一个一个的加image,然后连起来?还是等第一个试探的image收敛后,增加合适数量的images来从从新开始头计算,原来测试的第一个image就不要了?

(3)硬件配置和计算任务是否"般配"?估计要多长时间可以完成?N=5的话.

(4)有其他可能遇到的问题或者可以分享的,也欢迎跟贴分享.比如vtsttools命令的巧妙合适的运行.这个我很欠缺.

非常感谢!期待大家的帮助.

[ Last edited by cenwanglai on 2010-6-17 at 14:48 ]
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cenwanglai

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老和山猥琐派九段

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自己顶一下,呵呵,期待回复!
2楼2010-06-07 08:37:51
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cenwanglai

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老和山猥琐派九段

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自己来回答,呵呵.今天开始NEB计算,设置了一个中间插值.(1)没有问题,坐标是线形插值的,其他文字和注释不变.
3楼2010-06-07 09:50:46
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)

cenwanglai(金币+5):呵呵,谢谢回复!我不敢全部开来组计算,要留系统维护空间.6核运行三个image怎么样? 2010-06-08 12:48:35
8 核推荐四个Image...
4楼2010-06-07 14:09:10
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lfhuang

木虫 (著名写手)

cenwanglai(金币+10):谢谢黄老师的回复和链接 2010-06-08 12:59:21
建议楼主看一下NEB和其前身dimer算法的原始文献,因为NEB有时候特费机时,其中一些参数的修改会改善许多。参考:
http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=298464
先进使役材料计算(https://aidme.nimte.ac.cn)
5楼2010-06-07 14:57:36
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