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enola

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【分享】pwscf模拟水分子 已有5人参与

看见有人在MS版面上提到水分子的模拟,今天有空自己做了下,可是出来结果不对(输入时,特意把H-O-H键角是105 deg,但pw优化后成了97.5deg )不知道是不是水中的H得考虑自旋阿,还是其他有忽略的地方,输入文件如下,请大家批评阿:
&CONTROL
  calculation  = 'relax',
  prefix       = 'H2O',
  pseudo_dir   = '/home/enola/pwscf/espresso-3.2.3/pseudo',
  outdir       = '/home/enola/tmp',
  tprnfor=.ture
  forc_conv_thr=1.0D-4
          nstep=100
/
&SYSTEM
  ibrav     = 0,
  nat       = 3,
  ntyp      = 2,
  ecutwfc   = 35.D0,
  ecutrho   = 150.D0,
/
&ELECTRONS
  conv_thr    = 1.D-7,
  mixing_beta = 0.7D0,
/
&IONS
  ion_dynamics='bfgs',
  pot_extrapolation = 'second_order',
  wfc_extrapolation = 'second_order',
/
CELL_PARAMETERS cubic
20.0  0.0  0.0
0.0  20.0  0.0
0.0  0.0  20.0

ATOMIC_SPECIES
H 1.00d0 H.fpmd.UPF
O 16.0d0 O.BLYP.UPF

ATOMIC_POSITIONS (bohr)
   O     0.0099    0.0099    0.0000  
   H     1.4325   -0.2243   -0.0001  
   H    -0.2243    1.8325    0.0002
K_POINTS {Gamma}
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timeflies..
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identation

金虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
enola(金币+1): 2010-06-05 19:55:24
aylayl08(金币+1):谢谢指点 2010-06-05 20:29:11
可以把O原子固定了
另外,截断能需要测试
力的收敛标准是否低了
指定BFGS中能量收敛标准
2楼2010-06-05 15:39:32
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y1ding

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
enola(金币+1): 2010-06-05 19:55:28
aylayl08(金币+1):谢谢指点 2010-06-05 20:29:00
ecutrho   = 150.D0, 太低
赝势用的太诡异
3楼2010-06-05 18:19:42
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goldenfisher

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
enola(金币+2): 2010-06-05 19:55:33
aylayl08(金币+2):谢谢指点 2010-06-05 20:28:50
赝势用的是模守恒吧,我想ecutrho   = 150.D0应该差不多了。但是ecutwfc太小,有H在这里,你必须用大一些。建议至少60Ry.
此外,我想很可能是初始构型的问题。我对水分子进行过无数次优化,都是对的。
你可以考虑用别的赝势试一下。
版本太低了啊。呵呵
我总觉得整个输入文件缺点什么。

[ Last edited by goldenfisher on 2010-6-5 at 19:49 ]
4楼2010-06-05 19:47:24
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enola

捐助贵宾 (正式写手)

总结:加大截断能后,H2O正常拉。感谢帮组
timeflies..
5楼2010-06-06 10:10:57
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howberg

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
enola(金币+1):谢谢参与
cenwanglai(金币+2):呵呵,可以升级了。 2010-06-10 23:37:49
引用回帖:
Originally posted by enola at 2010-06-05 15:19:46:
看见有人在MS版面上提到水分子的模拟,今天有空自己做了下,可是出来结果不对(输入时,特意把H-O-H键角是105 deg,但pw优化后成了97.5deg )不知道是不是水中的H得考虑自旋阿,还是其他有忽略的地方,输入文件如 ...

我用pwscf做出了单体水 也做出了二聚体的水 结构也很好包括氢键,1.97Angstrom H-O为0.976Angstrom 104.5degree. 氢键能0.229eV是很好的还计算了diamond-phase Ice 也很好和实验符合的很好,给你一个建议,就是换一下势函数。我的问题是怎么加VdW修正?除了pwscf中的例子 要像cpmd中的VdW correction! thank you regards!
别人痴心相待,你却惺惺作态,等到你真心萌动,却只能叹缘浅情深,徒留悲切----人若自侮,然后人必侮之;不敢反抗本国侵害者的民族,必然是不敢反抗异国侵略者...
6楼2010-06-10 23:07:25
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