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houyanhui8

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于HIV基因组的 5’-LTR 已有2人参与

1 有个考研题目,感觉摸不着头脑,请各位帮忙

HIV基因组5’端有一段长的末端重复序列(5’-LTR),它对控制HIV的潜伏和激活起关键作用,因为它控制HIV的基因组的转录,请你设计出一个研究5’-LTR对基因转录的调控作用的方案,要求达到的目的是:①弄清楚5’-LTR 各部分序列对转录的作用。② 有哪些核内蛋白与LTR序列结合。条件:已有5’-LTR全长cDNA克隆。
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jingcp200320

银虫 (小有名气)


houyanhui8(金币+1):谢谢参与
好像在哪里见过这个,一般好像分步敲出重复序列来研究,最后哪些核内蛋白与LTR结合时用酵母双杂交来研究,好像cell有相关文章可以看到!方法差不多~!
2楼2010-06-07 11:00:52
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houyanhui8

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by jingcp200320 at 2010-06-07 11:00:52:
好像在哪里见过这个,一般好像分步敲出重复序列来研究,最后哪些核内蛋白与LTR结合时用酵母双杂交来研究,好像cell有相关文章可以看到!方法差不多~!

是的,是的,大体就是这个思路,将5’-LTR 各部分序列分别截断,有重叠的克隆到荧光素酶报告载体上,分析这些序列对报告基因的表达影响,从而推断出哪部分序列对5’-LTR下游的基因起调控作用;
第二问用凝胶电泳迁移率改变(Gel shift)
3楼2010-06-09 19:35:42
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