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cenwanglai荣誉版主 (知名作家)
老和山猥琐派九段
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【第一性原理活动贴】VASP 官方手册学习活动 已有31人参与
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作为初学者，当你面对“浩如烟海”的Tag不知所措的时候，请你参照manual； 作为入门者，当你想理解Vasp计算和Tag设置牵涉的物理图像的时候，请你阅读manual; 作为中级用户，当你想计算更多性质、想处理出更漂亮的数据而焦头烂额的时候，请你钻研manual； 作为高级用户，当你想超越平台，联合多种软件或工具实现特别计算的时候，请你品味manual； 作为“圣人”，当你想对第一性原理追根溯源、参禅悟道而不可得的时候，请你重温manual. Manual是为所有关注第一性原理人而写的，它可以作为软件的操作教程，也可以提供理论背景和指引，也是写得很有味道的艺术作品。 希望通过本次活动，无论是初学者还是老得发霉的虫子，都能从manual中得到启迪。 活动方案： （1）学习范围： 以Vasp manual 2009 为蓝本 下载地址（  ）：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1564821&pid=17403126&page=1#pid17403126从第5章Files used by VASP 到第15章 FAQ 共11章 （2）活动方式： 发贴者针对手册上不明白的地方提问，发提问贴，参照格式： [章节页码]： [原文内容]： [问题]： 发贴者就手册上的某些问题提出自己的看法、学习心得或者计算实例子，参照格式： [章节页码]： [原文内容]： [心得体会]： 回帖者引用后回答或者参与讨论。参照格式仅仅作为参考，好的内容可以不受限制，只要便于虫友识别交流就好。 （3）奖励办法： 奖励办法我去跟区长商量，目前参照第一性原理版对分享和回复贴奖励办法执行。 （4）非水区，勿灌水:dnd: 希望大家一起努力，一起提高，早日脱离软件器物层面的束缚，在第一性原理领域登堂入室。 [ Last edited by cenwanglai on 2010-6-3 at 23:20 ] |
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[章节页码]:6.51 P82 4.5 P34 [原文内容]: 6.51 P82 VASP currently overs parallelization (and data distribution) over bands and parallelization (and data distribution) over plane wave coeffcients (see also Section 4). To get a high effciency on massively parallel systems it is strongly recommended to use both at the same time. The only algorithm which works with the over band distribution is the RMM-DIIS iterative matrix diagonalization (IALGO=48). NPAR tells VASP to switch on parallelization (and data distribution) over bands. NPAR=1 implies distribution over plane wave coeffcients only (IALGO=8 and IALGO=48 both work), All nodes will work on each band. We suggest to use this default setting only when running on a small number of nodes. 4.5 P34 Partial local DOS is only supported with parallelization over plane wave coefficients but not with parallelization over bands. The reason is that some files (like PROCAR) have a rather complicated band-by-band layout, and it would be complicated to mimic this layout with a data distribution over bands. 6.33 P69 The parallel version has some restrictions: The site projected DOS is not evaluated in the parallel version in the following cases: VASP.4.5, NPAR!=1, no site projected DOS VASP.4.6, NPAR!=1, LORBIT=0-5 no site projected DOS ("!=" 表示不等于) [问题]:这两段话是关于并行以及产生PDOS(partial local DOS)的设置的. (1)NPAR=1表示parallelization over plane wave coefficients;>1 表示over bands?如何设置使得parallelization both of the same time? (2)RMM-DIIS(IALGO-48)是唯一支持parallelization over bands的算法?那这样的话只无论是单独parallelization over band 还是同时over plane wave over coefficients,电子迭带都只能用IALGO=48? (3)要计算PDOS只能设置NPAR=1? 只计算DOS的话不必只样吧? (4)如何设置LPLANE?对计算有什么样的影响? (5)要生成 site projected DOS(SPDOS) ,必须设置NPAR=1? SPDOS与PDOS是统一概念吗? [ Last edited by cenwanglai on 2010-6-5 at 12:25 ] |
10楼2010-06-05 11:43:39
