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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主


aylayl08(金币+1):谢谢提问 2010-06-30 18:07:58
引用回帖:
Originally posted by tfh00 at 2010-06-05 10:47:31:
小弟请教问题了,谢谢大家
[章节页码]:46  82
[原文内容]:ELF
[问题]:ELF和电荷密度的区别是是什么?

ELF是电子局域函数,应该是电荷密度数据的衍生信息吧?另外相关的还有电荷差分密度.还有一种把总电荷密度减去各原子电荷叠加的处理方法.都没理清楚,希望有人给予指点.
11楼2010-06-05 11:57:15
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小木虫于

金虫 (正式写手)

★ ★
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aylayl08(金币+1):感谢交流讨论 2010-06-30 18:07:47
parallelization (and data distribution) over bands
parallelization (and data distribution) over plane wave coeffcients
是什么意思呀?是对能带并行 和对平面波并行么?
大致是如何实现的呢?如和并行的呢?
12楼2010-06-06 08:48:54
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99813721

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
  支持一个 晚上用牛津高阶边看边查~~
13楼2010-06-06 16:40:59
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kgdu

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
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cenwanglai(金币+2):欢迎参与,谢谢支持! 2010-06-06 17:20:18
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-06-05 11:43:39:
[章节页码]:6.51 P82 4.5 P34
[原文内容]:
6.51 P82
VASP currently overs parallelization (and data distribution) over bands and parallelization (and data distribution) over plane wave coeffcients ( ...

我前一段时间刚好做了这样的并行参数设置,明白了一点点。
  NPAR好像是把cpu分成几个组,每个组算一个band。一般好像就取cpu核的个数,LPLANE=.TRUE.好像可以节省好多计算时间,我估计有20-30%,当然这可能对不同的计算机不一样。按照85页对不同机器给的设置,效率真是有很大提高,以前居然没发现。当然用这时,IALGO=48。NPAR!=1时,对于LORBIT=0-5,好像不能计算PDOS。
  有什么说得不对的,还请各们指正!
14楼2010-06-06 17:16:41
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gump_813276

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
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zzy870720z(金币+2):感谢交流,NPAR的作用不能这么肯定没有用处吧,呵呵 2010-06-10 12:20:09
我也有同感 LPLANE=.TRUE. 可以提高速度很多。
NPAR在我的经验看来 没太大作用
NSIM=4也可以提高速度

另外,编译的时候用fftw3可以提高很多速度
引用回帖:
Originally posted by kgdu at 2010-06-06 17:16:41:


我前一段时间刚好做了这样的并行参数设置,明白了一点点。
  NPAR好像是把cpu分成几个组,每个组算一个band。一般好像就取cpu核的个数,LPLANE=.TRUE.好像可以节省好多计算时间,我估计有20-30%,当然这可能 ...

15楼2010-06-10 10:57:33
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kgdu

金虫 (正式写手)

★ ★
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cenwanglai(金币+1):呵呵,谢谢参与! 2010-06-11 08:17:28
引用回帖:
Originally posted by gump_813276 at 2010-06-10 10:57:33:
我也有同感 LPLANE=.TRUE. 可以提高速度很多。
NPAR在我的经验看来 没太大作用
NSIM=4也可以提高速度

另外,编译的时候用fftw3可以提高很多速度



这个好像只能用于IALGO=48,但是有时候用这个计算不收敛,真是比较郁闷,你有没有用IALGO=48不收敛,调节参数使之收敛的经验呢?
16楼2010-06-10 11:18:15
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veryman

木虫 (正式写手)

$_$

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zzy870720z(金币+2):谢谢参与讨论学习,期待你更好的表现 2010-06-10 12:21:09
引用回帖:
Originally posted by tfh00 at 2010-06-05 10:47:31:
小弟请教问题了,谢谢大家
[章节页码]:46  82
[原文内容]:ELF
[问题]:ELF和电荷密度的区别是是什么?

ELF可以用于定量描述化学键,对于一直处于定性描述的量子化学领域是一个重大突破,但是其理论还非常不完善,分析起来也不是太容易。如果你是学化学出身的,可以看看Chem. Rev. 105(10): 3911.

顺便推荐推荐咱课题组用ELF分析的几篇文章做个参考
Appl Phys A (2010) 99: 961
http://www.springerlink.com/cont ... e7e9b8eab&pi=41
Solid State Communications doi:10.1016/j.ssc.2010.04.033
http://www.sciencedirect.com/sci ... 5daad20f085b13d5e7a
Phys. Chem. Chem. Phys. 12: 1585.
http://www.rsc.org/Publishing/Jo ... le.asp?doi=b920990e
17楼2010-06-10 12:18:36
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gump_813276

铜虫 (小有名气)


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这个是指fftw3吗?
引用回帖:
Originally posted by kgdu at 2010-06-10 11:18:15:


  这个好像只能用于IALGO=48,但是有时候用这个计算不收敛,真是比较郁闷,你有没有用IALGO=48不收敛,调节参数使之收敛的经验呢?

18楼2010-06-10 12:24:16
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迷路的游侠

木虫 (正式写手)


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强烈支持
19楼2010-06-10 13:47:35
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sars518

木虫 (著名写手)

小木虫灌水大队队长

★ ★
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zzy870720z(金币+1):谢谢指导 2010-06-10 20:01:39
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-06-05 11:57:15:


ELF是电子局域函数,应该是电荷密度数据的衍生信息吧?另外相关的还有电荷差分密度.还有一种把总电荷密度减去各原子电荷叠加的处理方法.都没理清楚,希望有人给予指点.

不算是衍生关系,ELF 具体的可参考

Becke AD, Edgecombe KE. J. Chem. Phys. 1990;92:5397.

Silvi B, Savin A. Nature 1994;371:683.
人生是一场旅行,在欣赏风景的同时,别忘了你也是别人的风景。
20楼2010-06-10 19:59:21
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