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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【第一性原理活动贴】VASP 官方手册学习活动
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★
aylayl08(金币+1):谢谢提问 2010-06-30 18:07:58
引用回帖:
Originally posted by tfh00 at 2010-06-05 10:47:31:
小弟请教问题了，谢谢大家
[章节页码]：46  82
[原文内容]：ELF
[问题]：ELF和电荷密度的区别是是什么？

ELF是电子局域函数,应该是电荷密度数据的衍生信息吧?另外相关的还有电荷差分密度.还有一种把总电荷密度减去各原子电荷叠加的处理方法.都没理清楚,希望有人给予指点.
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11楼2010-06-05 11:57:15
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小木虫于

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):感谢交流讨论 2010-06-30 18:07:47
parallelization (and data distribution) over bands
parallelization (and data distribution) over plane wave coeffcients
是什么意思呀？是对能带并行 和对平面波并行么？
大致是如何实现的呢？如和并行的呢？
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12楼2010-06-06 08:48:54
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99813721

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
  支持一个 晚上用牛津高阶边看边查~~
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13楼2010-06-06 16:40:59
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kgdu

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+2):欢迎参与,谢谢支持! 2010-06-06 17:20:18
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-06-05 11:43:39:
[章节页码]:6.51 P82 4.5 P34
[原文内容]:
6.51 P82
VASP currently overs parallelization (and data distribution) over bands and parallelization (and data distribution) over plane wave coeffcients ( ...

我前一段时间刚好做了这样的并行参数设置，明白了一点点。
  NPAR好像是把cpu分成几个组，每个组算一个band。一般好像就取cpu核的个数，LPLANE=.TRUE.好像可以节省好多计算时间，我估计有20-30%，当然这可能对不同的计算机不一样。按照85页对不同机器给的设置，效率真是有很大提高，以前居然没发现。当然用这时，IALGO=48。NPAR！=1时，对于LORBIT=0-5，好像不能计算PDOS。
  有什么说得不对的，还请各们指正！
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14楼2010-06-06 17:16:41
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gump_813276

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):感谢交流，NPAR的作用不能这么肯定没有用处吧，呵呵 2010-06-10 12:20:09
我也有同感 LPLANE=.TRUE. 可以提高速度很多。
NPAR在我的经验看来 没太大作用
NSIM=4也可以提高速度

另外，编译的时候用fftw3可以提高很多速度
引用回帖:
Originally posted by kgdu at 2010-06-06 17:16:41:


我前一段时间刚好做了这样的并行参数设置，明白了一点点。
  NPAR好像是把cpu分成几个组，每个组算一个band。一般好像就取cpu核的个数，LPLANE=.TRUE.好像可以节省好多计算时间，我估计有20-30%，当然这可能 ...

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15楼2010-06-10 10:57:33
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kgdu

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+1):呵呵,谢谢参与! 2010-06-11 08:17:28
引用回帖:
Originally posted by gump_813276 at 2010-06-10 10:57:33:
我也有同感 LPLANE=.TRUE. 可以提高速度很多。
NPAR在我的经验看来 没太大作用
NSIM=4也可以提高速度

另外，编译的时候用fftw3可以提高很多速度



这个好像只能用于IALGO=48，但是有时候用这个计算不收敛，真是比较郁闷，你有没有用IALGO=48不收敛，调节参数使之收敛的经验呢？
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16楼2010-06-10 11:18:15
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veryman

木虫 (正式写手)

$_$
★ ★ ★
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zzy870720z(金币+2):谢谢参与讨论学习，期待你更好的表现 2010-06-10 12:21:09
引用回帖:
Originally posted by tfh00 at 2010-06-05 10:47:31:
小弟请教问题了，谢谢大家
[章节页码]：46  82
[原文内容]：ELF
[问题]：ELF和电荷密度的区别是是什么？

ELF可以用于定量描述化学键，对于一直处于定性描述的量子化学领域是一个重大突破，但是其理论还非常不完善，分析起来也不是太容易。如果你是学化学出身的，可以看看Chem. Rev. 105(10): 3911.

顺便推荐推荐咱课题组用ELF分析的几篇文章做个参考
Appl Phys A (2010) 99: 961
http://www.springerlink.com/cont ... e7e9b8eab&pi=41
Solid State Communications doi:10.1016/j.ssc.2010.04.033
http://www.sciencedirect.com/sci ... 5daad20f085b13d5e7a
Phys. Chem. Chem. Phys. 12: 1585.
http://www.rsc.org/Publishing/Jo ... le.asp?doi=b920990e
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17楼2010-06-10 12:18:36
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gump_813276

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这个是指fftw3吗？
引用回帖:
Originally posted by kgdu at 2010-06-10 11:18:15:


  这个好像只能用于IALGO=48，但是有时候用这个计算不收敛，真是比较郁闷，你有没有用IALGO=48不收敛，调节参数使之收敛的经验呢？

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18楼2010-06-10 12:24:16
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迷路的游侠

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
强烈支持
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19楼2010-06-10 13:47:35
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sars518

木虫 (著名写手)

小木虫灌水大队队长
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢指导 2010-06-10 20:01:39
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-06-05 11:57:15:


ELF是电子局域函数,应该是电荷密度数据的衍生信息吧?另外相关的还有电荷差分密度.还有一种把总电荷密度减去各原子电荷叠加的处理方法.都没理清楚,希望有人给予指点.

不算是衍生关系，ELF 具体的可参考

Becke AD, Edgecombe KE. J. Chem. Phys. 1990;92:5397.

Silvi B, Savin A. Nature 1994;371:683.
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人生是一场旅行，在欣赏风景的同时，别忘了你也是别人的风景。
20楼2010-06-10 19:59:21
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