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qgqgrm

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于氢键 已有6人参与

请教高人和达人,MS中哪个模块可以处理分子间的氢键作用?
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孜孜以求
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢hou先生的指点 2010-06-02 16:30:47
对第一原理计算来说,还是个很大的挑战。找找那些基于经验势的MD模块,里面可能有描述氢键的经验势。
2楼2010-06-02 08:38:56
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qgqgrm

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-02 08:38:56:
对第一原理计算来说,还是个很大的挑战。找找那些基于经验势的MD模块,里面可能有描述氢键的经验势。

您的意思是说只能用分子动力学,Dmol和CASTEP都算不了?
孜孜以求
3楼2010-06-03 09:50:28
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coella

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-02 08:38:56:
对第一原理计算来说,还是个很大的挑战。找找那些基于经验势的MD模块,里面可能有描述氢键的经验势。

能说得具体点儿么?不太明白!做一些吸附的模拟时一般都要考虑氢键、范德华力等非键的作用,那么是说MS计算的准确度有待考虑么?具体和其他MD模块的区别可以介绍下吗?
不胜感激!
4楼2010-06-04 14:35:12
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zzgyb

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫警察局局长

优秀版主

★ ★
cenwanglai(金币+1):谢谢回复 2010-06-05 12:11:18
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-06-08 11:28:51
CASTEP
有一个基于量子力学的动力学
江南七怪+马玉+洪七公+一灯大师+周伯通教一个弱智儿童=郭靖,天下第一王重阳教七个天资不错的小孩=全真七子,全真七子×3《郭靖,这就是盲目扩招的后果
5楼2010-06-04 16:32:15
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-06-04 22:18:06
怎么基于DFT来处理范德瓦耳斯力,最近5、6年才有一些很大进展。
看看这里的文献:
www.physics.rutgers.edu/~langreth/preprints/erika2.ps
6楼2010-06-04 20:34:04
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qgqgrm

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-04 20:34:04:
怎么基于DFT来处理范德瓦耳斯力,最近5、6年才有一些很大进展。
看看这里的文献:
www.physics.rutgers.edu/~langreth/preprints/erika2.ps

谢谢你的文献。我不是专家,凭直觉,范德瓦耳斯力和氢键作用不太一样吧,后者包括了静电引力,而前者不包括。
认识浅陋,见笑,不过很希望能搞清楚,尤其是氢键作用的计算,还请指教。
孜孜以求
7楼2010-06-05 11:22:22
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ljyang320

木虫 (正式写手)

小书虫爱吃糖

★ ★ ★
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cenwanglai(金币+2):谢谢提供帮助 2010-06-05 13:23:44
引用回帖:
Originally posted by qgqgrm at 2010-06-02 06:52:20:
请教高人和达人,MS中哪个模块可以处理分子间的氢键作用?

我记得国内有一篇文献使用MS做的,就是利用他处理氢键的问题
:http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=9208842j4mq3xtklkqc7qdt
希望对你有所帮组
但使岁月静好,现世安稳!
8楼2010-06-05 12:48:58
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qgqgrm

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by ljyang320 at 2010-06-05 12:48:58:

我记得国内有一篇文献使用MS做的,就是利用他处理氢键的问题
:http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=9208842j4mq3xtklkqc7qdt
希望对你有所帮组

谢谢ljyang320  ,学习中!!!
孜孜以求
9楼2010-06-08 11:00:25
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人

★ ★
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gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-06-08 11:29:08
引用回帖:
Originally posted by qgqgrm at 2010-06-03 09:50:28:


您的意思是说只能用分子动力学,Dmol和CASTEP都算不了?

DOML和CASTEP都是可以进行第一原理分子动力学的。
10楼2010-06-08 11:26:01
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