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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】关于氢键
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qgqgrm

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于氢键 已有6人参与

请教高人和达人，MS中哪个模块可以处理分子间的氢键作用？
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孜孜以求
1楼 2010-06-02 06:52:20
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
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aylayl08(金币+2):谢谢hou先生的指点 2010-06-02 16:30:47
对第一原理计算来说，还是个很大的挑战。找找那些基于经验势的MD模块，里面可能有描述氢键的经验势。
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2楼2010-06-02 08:38:56
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qgqgrm

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-02 08:38:56:
对第一原理计算来说，还是个很大的挑战。找找那些基于经验势的MD模块，里面可能有描述氢键的经验势。

您的意思是说只能用分子动力学，Dmol和CASTEP都算不了？
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孜孜以求
3楼2010-06-03 09:50:28
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coella

木虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-02 08:38:56:
对第一原理计算来说，还是个很大的挑战。找找那些基于经验势的MD模块，里面可能有描述氢键的经验势。

能说得具体点儿么？不太明白！做一些吸附的模拟时一般都要考虑氢键、范德华力等非键的作用，那么是说MS计算的准确度有待考虑么？具体和其他MD模块的区别可以介绍下吗？
不胜感激！
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4楼2010-06-04 14:35:12
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zzgyb

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫警察局局长

优秀版主
★ ★
cenwanglai(金币+1):谢谢回复 2010-06-05 12:11:18
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-06-08 11:28:51
CASTEP
有一个基于量子力学的动力学
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江南七怪+马玉+洪七公+一灯大师+周伯通教一个弱智儿童=郭靖,天下第一王重阳教七个天资不错的小孩=全真七子,全真七子×3《郭靖,这就是盲目扩招的后果
5楼2010-06-04 16:32:15
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
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gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-06-04 22:18:06
怎么基于DFT来处理范德瓦耳斯力，最近5、6年才有一些很大进展。
看看这里的文献：
www.physics.rutgers.edu/~langreth/preprints/erika2.ps
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6楼2010-06-04 20:34:04
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qgqgrm

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-04 20:34:04:
怎么基于DFT来处理范德瓦耳斯力，最近5、6年才有一些很大进展。
看看这里的文献：
www.physics.rutgers.edu/~langreth/preprints/erika2.ps

谢谢你的文献。我不是专家，凭直觉，范德瓦耳斯力和氢键作用不太一样吧，后者包括了静电引力，而前者不包括。
认识浅陋，见笑，不过很希望能搞清楚，尤其是氢键作用的计算，还请指教。
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孜孜以求
7楼2010-06-05 11:22:22
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ljyang320

木虫 (正式写手)

小书虫爱吃糖
★ ★ ★
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cenwanglai(金币+2):谢谢提供帮助 2010-06-05 13:23:44
引用回帖:
Originally posted by qgqgrm at 2010-06-02 06:52:20:
请教高人和达人，MS中哪个模块可以处理分子间的氢键作用？

我记得国内有一篇文献使用MS做的，就是利用他处理氢键的问题
:http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=9208842j4mq3xtklkqc7qdt
希望对你有所帮组
赞一下(2人) 回复此楼
但使岁月静好，现世安稳！
8楼2010-06-05 12:48:58
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qgqgrm

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ljyang320 at 2010-06-05 12:48:58:

我记得国内有一篇文献使用MS做的，就是利用他处理氢键的问题
:http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=9208842j4mq3xtklkqc7qdt
希望对你有所帮组

谢谢ljyang320  ，学习中！！！
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孜孜以求
9楼2010-06-08 11:00:25
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yzcluster

金虫 (著名写手)

小木虫扫盲人
★ ★
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gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-06-08 11:29:08
引用回帖:
Originally posted by qgqgrm at 2010-06-03 09:50:28:


您的意思是说只能用分子动力学，Dmol和CASTEP都算不了？

DOML和CASTEP都是可以进行第一原理分子动力学的。
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10楼2010-06-08 11:26:01
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