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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wujiangjie

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】关于Gromacs里建立金属模型 已有4人参与

各位大虾,请问有人在Gromacs里面建立金属颗粒的模型吗?Gromacs里面没有那个立场,自己手动加入,那么如何建立这个模型呢?以及如何加入真空层?谢谢
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wujiangjie

木虫 (正式写手)

是不是遇到贵金属Au,Ag体系等,大家一般都不用Gromacs了?
2楼2010-05-27 09:34:38
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-05-27 13:22:18
引用回帖:
Originally posted by wujiangjie at 2010-05-27 09:18:24:
各位大虾,请问有人在Gromacs里面建立金属颗粒的模型吗?Gromacs里面没有那个立场,自己手动加入,那么如何建立这个模型呢?以及如何加入真空层?谢谢

gromacs干这个貌似确实不怎么好
分子模拟的主页http://varmilion.tk/
3楼2010-05-27 12:00:29
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qasd

木虫 (著名写手)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-28 08:29:02
貌似要用势表,gromacs那些势函数对金属都不怎么适用
4楼2010-05-27 20:52:48
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子陵263

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-28 08:29:14
不用Gromacs用什么,用AMBER吗 或者NAMD
5楼2010-05-28 08:25:52
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wujiangjie

木虫 (正式写手)

那如果我自己添加金属势能参数呢?原则上是不是只要有立场就可以使用了
6楼2010-05-29 10:06:50
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