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zhoujuanlvluo

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】hyperchem模拟的问题 已有3人参与

选中分子后,“Setup”里面选折"Semi-empirical",选折“PM3”。Compute里面选“Geometry optimizaition”,RMS gradient = 0.1; maximum cycles = 10
但是模拟最简单的苯环体系的时候都出现了“苯环严重变形扭曲”,感觉明显不对,请高手指教
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童心

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-05-25 10:02:42
你要检查要最初始结构的苯环是否正确,尤其是你用别的工具画的结构导入Hyperchem的时候,导致结构识别不正确,最好先用MM稍微跑下,这样可以让系统正确识别结构。
2楼2010-05-25 09:05:35
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童心

木虫 (正式写手)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-05-25 10:02:51
当然,最佳办法是用hyperchem自己画结构,不过我一般用chemdraw保存为mol2
3楼2010-05-25 09:06:28
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zhoujuanlvluo

银虫 (小有名气)

我也是采用的chemdraw画的,保存为mol格式,然后导入hyperchem的。模拟设置有什么地方需要注意的吗?
4楼2010-05-25 12:12:42
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chongchong11

至尊木虫 (著名写手)

Senior Engineer

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-25 19:00:56
采用CHEMDRAW画好后先用MM跑一下,保存为MOL然后再在HYPERCHEM中用你说的方法弄。
Nature+Science=Wisdom
5楼2010-05-25 18:48:39
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zhoujuanlvluo

银虫 (小有名气)

谢谢了。刚开始用,哈哈,还有好多都不太会
6楼2010-05-25 22:10:25
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