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Inorg@USF

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】一个小问题:如何AFIX 甲醇和水上的氢原子... 已有4人参与

查了查,总是不得要领

是AFIX 147吗? Ueq = -1.2 还是 -1.5?

盼解!
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There is a will,there is a way.
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greenbest

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
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yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-05-22 22:40:21
147 羟基,1.2
世界上最远的距离  不是生与死的距离  而是我站在你面前你不知道我爱你
2楼2010-05-22 14:04:05
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Inorg@USF

木虫 (正式写手)

谢谢~~~

我试过了,加上后,出现“refinement unstable"的警告,删除AFIX 147 和-1.2后再计算,残峰变大!

盼解
引用回帖:
Originally posted by greenbest at 2010-05-22 14:04:05:
147 羟基,1.2

There is a will,there is a way.
3楼2010-05-22 14:08:06
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Inorg@USF

木虫 (正式写手)

again!

计算突然不稳定,GOOF, R1, wR1都陡然变大。残峰几乎都出现在一个溶剂分子的C原子周围,竟然达20几! 但是结构上貌似已经在化学意义上合理了,郁闷~~
There is a will,there is a way.
4楼2010-05-22 14:15:44
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wsyy163

银虫 (正式写手)

★ ★
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yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-05-22 22:40:12
那你就计算一下理论位置
然后强行定下来就可以了
5楼2010-05-22 15:04:09
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Inorg@USF

木虫 (正式写手)

嗯,我把那个”骚乱“的溶剂分子删掉,重新refine了一下,定下来了。各个值也趋于正常。

新的问题是:
对于有些disorder的溶剂分子中的原子是否可以不做anis处理?

还有就是如果有NON POSITIVE DEFINITE (NPD)原子,如何处理之?

有的书里介绍书可以用simu和delu命令处理,不是很明白,请问如何处理?
引用回帖:
Originally posted by wsyy163 at 2010-05-22 15:04:09:
那你就计算一下理论位置
然后强行定下来就可以了

There is a will,there is a way.
6楼2010-05-22 16:10:45
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dongdong6930

金虫 (正式写手)

★ ★
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yanhualover(金币+1):期待你的精彩回答 2010-05-22 22:40:04
你试试理论HFix 然后会自动产生这些固定命令的!
7楼2010-05-22 21:45:54
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Inorg@USF

木虫 (正式写手)


wsht212(金币+1):好方法,有些峰对于HFIX效果是不好 2010-05-23 10:32:07
谢谢,试过了,不好用,可能是因为相关溶剂分子上的O,C热振动太大了。 我通过找残峰找到了。用DFIX固定住,可行。
引用回帖:
Originally posted by dongdong6930 at 2010-05-22 21:45:54:
你试试理论HFix 然后会自动产生这些固定命令的!

There is a will,there is a way.
8楼2010-05-23 02:33:21
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greenbest

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-05-23 14:25:43
引用回帖:
Originally posted by Inorg@USF at 2010-05-22 14:08:06:
谢谢~~~

我试过了,加上后,出现“refinement unstable"的警告,删除AFIX 147 和-1.2后再计算,残峰变大!

盼解


是不是溶剂无序?
世界上最远的距离  不是生与死的距离  而是我站在你面前你不知道我爱你
9楼2010-05-23 10:48:04
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